More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3706 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 359 aa  739    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  72.96 
 
 		 357 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  71.83 
 
 		 355 aa  551  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  70.06 
 
 		 357 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  58.71 
 
 		 358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 357 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  58.59 
 
 		 354 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  58.19 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  56.46 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 356 aa  401  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 355 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  51.68 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 357 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  53.5 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  51.26 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  52.41 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2682  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 364 aa  381  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 367 aa  381  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  48.17 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  51.6 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 357 aa  371  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  48.01 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  51.51 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  48.14 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  48.01 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  52.32 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  48.18 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 363 aa  366  1e-100  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  49.26 
 
 		 360 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  47.44 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  47.16 
 
 		 360 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>