More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3189 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  100 
 
 		 290 aa  604  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  77.67 
 
 		 302 aa  495  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  77.93 
 
 		 292 aa  484  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  70 
 
 		 292 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  69.4 
 
 		 304 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  59.39 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  61.51 
 
 		 290 aa  361  6e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  61.37 
 
 		 288 aa  360  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  59.14 
 
 		 299 aa  359  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  54.91 
 
 		 298 aa  328  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  54.68 
 
 		 298 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  53.96 
 
 		 298 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 321 aa  310  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  51.94 
 
 		 298 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  51.27 
 
 		 290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  50 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  50 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  50 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  301  9e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  301  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  301  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  301  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  50.55 
 
 		 323 aa  298  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  48.74 
 
 		 303 aa  295  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  48.74 
 
 		 303 aa  295  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  50.92 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  50.92 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  47.9 
 
 		 321 aa  292  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  50.92 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  47.55 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 287 aa  289  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 282 aa  288  6e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  47.75 
 
 		 324 aa  287  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 292 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  45.7 
 
 		 340 aa  286  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  45.7 
 
 		 338 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  45.7 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  45.7 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 294 aa  285  7e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  46.05 
 
 		 335 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  46.39 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  48.74 
 
 		 350 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  45.7 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  48 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  45.24 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  48.35 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  47.39 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  45.7 
 
 		 327 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  47.46 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  50 
 
 		 289 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  47.1 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  49.08 
 
 		 325 aa  280  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  47.1 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  45.36 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  48.4 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  46.6 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  46.39 
 
 		 324 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  47.25 
 
 		 321 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  45.86 
 
 		 329 aa  278  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 289 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  49.28 
 
 		 289 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  46.89 
 
 		 322 aa  277  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  46.93 
 
 		 282 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 294 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 334 aa  277  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  46.21 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  45.52 
 
 		 329 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  45.52 
 
 		 329 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  47.99 
 
 		 322 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  45.52 
 
 		 329 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  48.18 
 
 		 315 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  45.39 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  48.54 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  46.98 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  46.93 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  45.99 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  47.16 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  47.62 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  45.39 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  45.39 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  46.64 
 
 		 291 aa  275  8e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  46.01 
 
 		 300 aa  275  8e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  46.35 
 
 		 329 aa  275  9e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>