212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0075 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0075  putative highly acidic protein  100 
 
 
177 aa  367  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00000264098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.88 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  30.95 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.85 
 
 
487 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1133  Sel1  28.74 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3770  Sel1 domain-containing protein  25.73 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.476398  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.47 
 
 
318 aa  65.1  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.51 
 
 
789 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  31.29 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  28.33 
 
 
961 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
1032 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  31.16 
 
 
228 aa  59.7  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.47 
 
 
831 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
346 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  28.33 
 
 
684 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  28.78 
 
 
393 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  29.66 
 
 
482 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.05 
 
 
209 aa  57.8  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.51 
 
 
425 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  29.3 
 
 
1044 aa  57  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  31.4 
 
 
368 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.13 
 
 
464 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  29.3 
 
 
1078 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.5 
 
 
1402 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  27.41 
 
 
273 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  28.79 
 
 
218 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.23 
 
 
264 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 
341 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  32.73 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  25.93 
 
 
246 aa  55.1  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  26.15 
 
 
305 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
252 aa  55.1  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.84 
 
 
321 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  25.75 
 
 
489 aa  55.1  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  25.16 
 
 
235 aa  54.7  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
976 aa  54.3  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  28.57 
 
 
376 aa  54.3  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0106  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 
454 aa  54.3  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.68 
 
 
392 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.9 
 
 
528 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
448 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  26.62 
 
 
557 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.73 
 
 
271 aa  52.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  32.5 
 
 
321 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  27.78 
 
 
376 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  29.92 
 
 
490 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  22.02 
 
 
209 aa  51.6  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  30 
 
 
357 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.75 
 
 
255 aa  51.2  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.14 
 
 
865 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  29.63 
 
 
231 aa  51.2  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.55 
 
 
490 aa  50.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  26.01 
 
 
260 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.12 
 
 
297 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0170964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0976  Sel1 domain-containing protein  27.4 
 
 
269 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.135872  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  26.01 
 
 
258 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.01 
 
 
380 aa  50.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
303 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.23 
 
 
509 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.46 
 
 
1877 aa  49.7  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  31.58 
 
 
331 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2828  Sel1-like  28.57 
 
 
531 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0495892  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  27.01 
 
 
315 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.87 
 
 
1261 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  28.23 
 
 
509 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.23 
 
 
509 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.23 
 
 
685 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.23 
 
 
509 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.06 
 
 
382 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  33.7 
 
 
357 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  25.66 
 
 
258 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  27.78 
 
 
1086 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.1 
 
 
363 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  26.67 
 
 
359 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  32.06 
 
 
276 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.92 
 
 
1110 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  27.64 
 
 
344 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  29.17 
 
 
346 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  28.68 
 
 
971 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 
971 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.17 
 
 
890 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  33.04 
 
 
415 aa  48.5  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.85 
 
 
1037 aa  48.5  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 
132 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.92 
 
 
1493 aa  48.1  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.31 
 
 
222 aa  48.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3856  Sel1 domain-containing protein  29.6 
 
 
272 aa  48.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  26.19 
 
 
212 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.62 
 
 
731 aa  48.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  26.67 
 
 
416 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  29.03 
 
 
367 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  25.78 
 
 
693 aa  47.8  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  28.57 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.33 
 
 
373 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  25.49 
 
 
234 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.52 
 
 
2413 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
221 aa  47.4  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4035  Sel1 domain-containing protein  24.43 
 
 
277 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.163286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  26.49 
 
 
257 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>