42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1133 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1133  Sel1  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0075  putative highly acidic protein  28.74 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00000264098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.03 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  26.76 
 
 		 348 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2933  tetratricopeptide TPR_2  24.18 
 
 		 287 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  25.5 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  30.25 
 
 		 301 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30 
 
 		 1037 aa  46.6  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.58 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2511  Sel1-like protein  25.87 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.41 
 
 		 490 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13810  Sel1 repeat protein  32.93 
 
 		 295 aa  45.8  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  24.66 
 
 		 393 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  28.12 
 
 		 1003 aa  44.7  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.14 
 
 		 346 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.57 
 
 		 685 aa  44.7  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  31.09 
 
 		 693 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.99 
 
 		 490 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  29.84 
 
 		 315 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  28.23 
 
 		 464 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  24.31 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  25 
 
 		 684 aa  43.9  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  25.98 
 
 		 359 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  24.75 
 
 		 376 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  26.12 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  28.1 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  28.04 
 
 		 254 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.64 
 
 		 392 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  25.32 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1032 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.62 
 
 		 341 aa  42.4  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.62 
 
 		 382 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  32.41 
 
 		 273 aa  42.4  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  28.78 
 
 		 415 aa  42  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  24.6 
 
 		 305 aa  42  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 971 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  28.57 
 
 		 357 aa  42  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  23.81 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  19.61 
 
 		 232 aa  41.2  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 976 aa  41.6  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  28.44 
 
 		 321 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>