More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1233 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1233  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
166 aa  343  4e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1962  methyl-accepting chemotaxis protein  77.71 
 
 
166 aa  273  6e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0158  PAS sensor protein  69.14 
 
 
170 aa  248  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00559927  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1012  methyl-accepting chemotaxis protein  61.25 
 
 
171 aa  221  4e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63093  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0044  putative PAS/PAC sensor protein  60.9 
 
 
162 aa  206  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0368  PAS sensor protein  54.61 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1323  methyl-accepting chemotaxis protein  51.55 
 
 
165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1204  methyl-accepting chemotaxis protein  51.55 
 
 
165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0540  methyl-accepting chemotaxis protein  51.23 
 
 
166 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0964  putative PAS domain signal transduction sensor protein  50.62 
 
 
163 aa  174  7e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.695373  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1206  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1325  methyl-accepting chemotaxis protein  49.38 
 
 
164 aa  170  9e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0735034  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.33 
 
 
182 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4975  putative PAS/PAC sensor protein  49.1 
 
 
178 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4662  putative PAS/PAC sensor protein  47.62 
 
 
168 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.193201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4009  PAS  48.15 
 
 
172 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4683  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
173 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1071  putative PAS/PAC sensor protein  47.31 
 
 
178 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1413  putative PAS/PAC sensor protein  46.06 
 
 
185 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.026067  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1312  putative PAS/PAC sensor protein  48.72 
 
 
174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  0.171791 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0963  putative PAS domain signal transduction sensor protein  48.12 
 
 
163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.598174  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2378  transcriptional regulator  47.85 
 
 
174 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4792  putative PAS/PAC sensor protein  46.79 
 
 
174 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4977  putative PAS/PAC sensor protein  44.64 
 
 
177 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05500  PAS domain S-box  43.4 
 
 
194 aa  158  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.51 
 
 
174 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0920  putative PAS/PAC sensor protein  49.68 
 
 
170 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3403  PAS sensor protein  44.44 
 
 
189 aa  147  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2233  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
177 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3464  transcriptional regulator  41.72 
 
 
174 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1223  signal-transduction sensor protein  40.24 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.658782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2936  putative PAS/PAC sensor protein  41.45 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2525  putative PAS/PAC sensor protein  41.36 
 
 
208 aa  131  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0659487  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1521  putative PAS/PAC sensor protein  38.36 
 
 
228 aa  124  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.950455  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1378  putative PAS/PAC sensor protein  37.04 
 
 
200 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.28 
 
 
550 aa  121  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6942  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.27 
 
 
566 aa  120  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.51 
 
 
556 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2920  aerotaxis sensor receptor  47.15 
 
 
549 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06258  hypothetical protein  44.93 
 
 
520 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1652  putative PAS/PAC sensor protein  44 
 
 
127 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.129926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1150  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.46 
 
 
522 aa  117  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.46 
 
 
522 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000496  methyl-accepting chemotaxis protein  43.18 
 
 
520 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232366  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.46 
 
 
522 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.737349  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0602  methyl-accepting chemotaxis protein  44.44 
 
 
536 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  44.26 
 
 
565 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.6 
 
 
543 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 
522 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 
522 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0615962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3073  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.53 
 
 
522 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000166485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3595  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 
515 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2812  putative PAS/PAC sensor protein  44 
 
 
166 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.494423  decreased coverage  0.000000324615 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1964  putative PAS/PAC sensor protein  36.42 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24380  aerotaxis receptor Aer  41.6 
 
 
567 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
520 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.15 
 
 
579 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.56 
 
 
524 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0725  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 
495 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.61 
 
 
532 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.415489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.09 
 
 
519 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0176898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.65 
 
 
520 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1522  PAS sensor protein  33.96 
 
 
225 aa  111  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.533099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.11 
 
 
519 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0729  PAS  40.6 
 
 
945 aa  111  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0635035  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2726  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.8 
 
 
538 aa  111  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4521  aerotaxis receptor, putative  46.09 
 
 
521 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0532  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.65 
 
 
523 aa  111  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0374128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.22 
 
 
521 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00326538  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.48 
 
 
598 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.09 
 
 
521 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664053  normal  0.0821551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 
534 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1294  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.39 
 
 
575 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00873235 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1618  chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
557 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.126465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.65 
 
 
519 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  43.48 
 
 
521 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3404  methyl-accepting chemotaxis protein  44 
 
 
522 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.48 
 
 
521 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.48 
 
 
521 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3735  PAS  41.94 
 
 
521 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 
521 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44300  aerotaxis receptor Aer  45.22 
 
 
521 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1648  aerotaxis receptor  40 
 
 
521 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.6 
 
 
529 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226395  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.6 
 
 
529 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1214  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.68 
 
 
527 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0580  hypothetical protein  36.24 
 
 
407 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.376144  hitchhiker  0.000000596414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0674  PAS  38.26 
 
 
544 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.6 
 
 
511 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3406  PAS  42.61 
 
 
521 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387271  normal  0.671486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
521 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.258308  normal  0.504821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2022  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.15 
 
 
748 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03711  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  38.35 
 
 
529 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.611118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0130  PAS sensor protein  35.48 
 
 
451 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.74 
 
 
522 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  43.48 
 
 
521 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2014  aerotaxis receptor  42.61 
 
 
521 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1125  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.23 
 
 
532 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1684  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.81 
 
 
525 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>