150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1179 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1179  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B (Asp/Glu-ADT subunit B)  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.02 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.05 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.2 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  29.41 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  26.75 
 
 
271 aa  101  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  29.03 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  34.03 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  28.64 
 
 
263 aa  92  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  29.27 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  29.27 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  32.88 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  32.88 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  28.93 
 
 
253 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  28.93 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  26.55 
 
 
429 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  28.93 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  26.27 
 
 
310 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  26.73 
 
 
289 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  27.19 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  27.64 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  28.18 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  29.68 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  30.3 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  28.48 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  28.48 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  28.48 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  28.48 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  28.48 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  28.48 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  28.48 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  28.48 
 
 
437 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  27.17 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  27.92 
 
 
460 aa  79.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  28.22 
 
 
460 aa  79.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  36.69 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  36.69 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  24.8 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  37.21 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  37.21 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  23.28 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  37.21 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  27.18 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  31.15 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  24.5 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  30.48 
 
 
452 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  25.93 
 
 
453 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.04 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  25.84 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  21.76 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  29.14 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  37.35 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  37.35 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  24.84 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  27.48 
 
 
456 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  33.59 
 
 
469 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  26.16 
 
 
449 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  24.6 
 
 
449 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  24.85 
 
 
434 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  24.2 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  24.85 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  24.85 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  24.85 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  29.94 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  31.19 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  29.58 
 
 
434 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  25.63 
 
 
443 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  27.42 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  30.85 
 
 
434 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  23.7 
 
 
313 aa  62  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  29.36 
 
 
374 aa  62  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  29.5 
 
 
438 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  34.06 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.32 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  27.92 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  27.92 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  28.42 
 
 
426 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  23.41 
 
 
458 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  28.42 
 
 
421 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  27.14 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  28.42 
 
 
421 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  28.42 
 
 
421 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  28.42 
 
 
421 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  28.42 
 
 
421 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  28.42 
 
 
421 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  23.41 
 
 
458 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  27.04 
 
 
433 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  27.04 
 
 
433 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  27.04 
 
 
433 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  25.95 
 
 
433 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  25.52 
 
 
415 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  27.56 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.57 
 
 
489 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  28.16 
 
 
220 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  25.68 
 
 
494 aa  59.3  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  28.16 
 
 
261 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  28.16 
 
 
261 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  21.43 
 
 
327 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  25.32 
 
 
436 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  24.24 
 
 
463 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>