More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0011 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0011  phosphomethylpyrimidine kinase superfamily protein  100 
 
 
244 aa  494  1e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0496  phosphomethylpyrimidine kinase  51.64 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0399  phosphomethylpyrimidine kinase  45.71 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 
268 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  34.88 
 
 
271 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  37.11 
 
 
268 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  37.11 
 
 
268 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  36.96 
 
 
288 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  36.96 
 
 
288 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  35.66 
 
 
260 aa  148  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  35.86 
 
 
268 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  34.94 
 
 
288 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  37.4 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  36.78 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  35.29 
 
 
268 aa  138  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  34.1 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  33.98 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  34.38 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  34.1 
 
 
436 aa  137  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  36.12 
 
 
490 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  35.32 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  33.9 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  34.69 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  38.49 
 
 
260 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  36.05 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  34.38 
 
 
266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  33.86 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  36.67 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  35.86 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  34.41 
 
 
449 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  33.84 
 
 
264 aa  129  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  34.26 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  35.24 
 
 
497 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  35.25 
 
 
293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  35 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  34.75 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  34.17 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 
277 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  36.29 
 
 
285 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  34.17 
 
 
264 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  32.42 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  34.35 
 
 
265 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
269 aa  125  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  33.07 
 
 
267 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  31.28 
 
 
297 aa  124  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  35.29 
 
 
266 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
270 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
270 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
270 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
270 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
270 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  33.77 
 
 
492 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  35.32 
 
 
272 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  34.25 
 
 
264 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 
264 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  31.64 
 
 
267 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  34.63 
 
 
269 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  31.64 
 
 
444 aa  122  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  34.94 
 
 
290 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
283 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07930  bifunctional enzyme, hydroxymethylpyrimidine kinase / phosphomethylpyrimidine kinase  31.7 
 
 
279 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0236651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  34.68 
 
 
299 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  31.54 
 
 
450 aa  122  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  37.85 
 
 
270 aa  122  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  34.18 
 
 
270 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 
266 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
266 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  32.81 
 
 
266 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  34.14 
 
 
264 aa  121  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
269 aa  121  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
270 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  32.8 
 
 
518 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  35.09 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  33.74 
 
 
275 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  31.85 
 
 
531 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  33.6 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0223  phosphomethylpyrimidine kinase  33.86 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.964465  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
264 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  33.76 
 
 
273 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  32.06 
 
 
323 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  35.27 
 
 
257 aa  120  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  34.38 
 
 
449 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  30.98 
 
 
335 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>