261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1472 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  100 
 
 
381 aa  764  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1501  hypothetical protein  35.66 
 
 
401 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1482  hypothetical protein  35.66 
 
 
401 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  32.67 
 
 
413 aa  74.3  3e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.09 
 
 
179 aa  74.7  3e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2391  cyclic nucleotide-binding protein  30.34 
 
 
164 aa  69.7  7e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 
225 aa  69.7  9e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  30.83 
 
 
165 aa  69.3  1e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  34.07 
 
 
169 aa  67.8  3e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.15 
 
 
228 aa  68.2  3e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  30.99 
 
 
1048 aa  67.4  4e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  31.85 
 
 
169 aa  67  5e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
598 aa  67  6e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  35.09 
 
 
144 aa  65.9  1e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.34 
 
 
224 aa  64.7  2e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.14 
 
 
226 aa  63.9  4e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  30.07 
 
 
164 aa  63.5  6e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  32.46 
 
 
158 aa  63.5  6e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
151 aa  62.8  9e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  29.29 
 
 
581 aa  61.6  2e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  29.25 
 
 
449 aa  61.2  3e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 
577 aa  60.8  3e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.09 
 
 
219 aa  61.2  3e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.07267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.84 
 
 
225 aa  61.2  3e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  31.73 
 
 
156 aa  61.2  3e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.58 
 
 
228 aa  61.2  3e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 
226 aa  60.8  3e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  33.67 
 
 
570 aa  60.8  4e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
225 aa  60.5  4e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 
171 aa  58.9  1e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  31.11 
 
 
147 aa  58.9  1e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.79 
 
 
225 aa  59.3  1e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 
225 aa  58.9  1e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 
161 aa  58.9  2e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.69 
 
 
212 aa  58.2  2e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.78 
 
 
228 aa  58.5  2e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  29.55 
 
 
155 aa  58.5  2e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
252 aa  57.8  3e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 
149 aa  56.2  8e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  31.48 
 
 
157 aa  56.2  9e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  28.57 
 
 
528 aa  56.2  9e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.17 
 
 
225 aa  55.8  1e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.89 
 
 
225 aa  56.2  1e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  28.78 
 
 
161 aa  55.5  2e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  26.26 
 
 
583 aa  55.1  2e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 
149 aa  55.1  2e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
227 aa  55.1  2e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  30.52 
 
 
157 aa  54.7  3e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
151 aa  54.3  3e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.96 
 
 
224 aa  54.3  3e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.81 
 
 
226 aa  54.7  3e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  30.21 
 
 
948 aa  54.7  3e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  30.53 
 
 
308 aa  53.9  4e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  25.17 
 
 
226 aa  53.9  4e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  30.69 
 
 
194 aa  54.3  4e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  23.91 
 
 
286 aa  54.3  4e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
248 aa  53.5  5e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  28.06 
 
 
153 aa  53.5  6e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 
503 aa  53.5  6e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  29.7 
 
 
332 aa  53.1  8e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  29.7 
 
 
332 aa  53.1  8e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  29.6 
 
 
152 aa  53.1  8e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  26.8 
 
 
167 aa  53.1  9e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.36 
 
 
146 aa  52.8  9e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4818  cyclic nucleotide-binding protein  30.93 
 
 
332 aa  52.4  1e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931859  normal  0.928656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  29.7 
 
 
332 aa  52.8  1e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 
148 aa  52.4  1e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4086  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.03 
 
 
209 aa  52.4  1e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0944516 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  27.34 
 
 
153 aa  52.4  1e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.73 
 
 
624 aa  52.8  1e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.88 
 
 
424 aa  52.8  1e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.24 
 
 
225 aa  52  2e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  28.57 
 
 
154 aa  51.6  2e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0236  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.84 
 
 
179 aa  51.6  2e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.754806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  23.49 
 
 
563 aa  52  2e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.32 
 
 
235 aa  51.6  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  25.17 
 
 
410 aa  52  2e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.76 
 
 
242 aa  52  2e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  26.8 
 
 
167 aa  51.6  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  24.41 
 
 
584 aa  52  2e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 
160 aa  51.2  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  28.03 
 
 
158 aa  51.2  3e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  26.81 
 
 
153 aa  51.2  3e-05  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  25.17 
 
 
419 aa  51.2  3e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  29.81 
 
 
231 aa  51.2  3e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.79 
 
 
220 aa  51.2  3e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48221e-05 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
247 aa  50.8  4e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.34 
 
 
225 aa  50.4  4e-05  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.9 
 
 
487 aa  50.8  4e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
231 aa  50.8  4e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  26.81 
 
 
153 aa  50.8  4e-05  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  24.18 
 
 
412 aa  50.4  5e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.08 
 
 
225 aa  50.4  5e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 
227 aa  50.4  6e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.48 
 
 
231 aa  50.4  6e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  26.12 
 
 
225 aa  50.4  6e-05  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.48 
 
 
1075 aa  50.1  6e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 
237 aa  50.1  6e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  29.47 
 
 
860 aa  50.1  7e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  25.77 
 
 
231 aa  50.1  7e-05  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>