More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04805 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  100 
 
 
533 aa  1058  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  53.42 
 
 
584 aa  572  1e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  42.28 
 
 
683 aa  293  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  35.73 
 
 
504 aa  286  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  35.45 
 
 
527 aa  281  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  36.48 
 
 
451 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  32.61 
 
 
516 aa  275  2e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  33.05 
 
 
544 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  35.25 
 
 
501 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  35.16 
 
 
463 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  33.57 
 
 
534 aa  256  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  33.21 
 
 
499 aa  255  1e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  4.22142e-07 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  35.23 
 
 
463 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  33.52 
 
 
496 aa  253  4e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  33.61 
 
 
544 aa  248  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 
471 aa  247  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  32.91 
 
 
495 aa  247  5e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  39.48 
 
 
479 aa  246  9e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  42.45 
 
 
490 aa  244  2e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.91592e-07  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  43.18 
 
 
491 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  42.33 
 
 
462 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  42.54 
 
 
489 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.17071e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  39.9 
 
 
490 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.1541e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  39.9 
 
 
489 aa  241  3e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  39.9 
 
 
489 aa  241  3e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  6.07679e-08  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  39.9 
 
 
489 aa  240  6e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.02128e-07  hitchhiker  7.91426e-06 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  35.26 
 
 
528 aa  239  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  40.77 
 
 
500 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.47826e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  41.88 
 
 
489 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  40.66 
 
 
462 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  31.94 
 
 
497 aa  234  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  30.85 
 
 
517 aa  234  4e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  31.98 
 
 
517 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  37.64 
 
 
501 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  41.78 
 
 
501 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.44318e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  41.51 
 
 
501 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  41.51 
 
 
501 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.64206e-06  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  32.55 
 
 
477 aa  230  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  3.22625e-05  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  41.46 
 
 
501 aa  227  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  45.87 
 
 
324 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  34.65 
 
 
436 aa  226  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  3.08736e-09  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  31.9 
 
 
509 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  32.52 
 
 
483 aa  225  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  31.6 
 
 
498 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  29.95 
 
 
566 aa  222  1e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  35.9 
 
 
446 aa  216  8e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  35.9 
 
 
446 aa  216  8e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  31.49 
 
 
497 aa  214  3e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  45.67 
 
 
432 aa  214  3e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  31.56 
 
 
484 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  32.91 
 
 
499 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  30.37 
 
 
501 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  30.37 
 
 
501 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  31.79 
 
 
512 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  31.79 
 
 
512 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  40.91 
 
 
444 aa  208  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  34.72 
 
 
461 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.67379e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  29.49 
 
 
558 aa  206  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  34.95 
 
 
461 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.79332e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  34.49 
 
 
461 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.40471e-06  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  34.49 
 
 
461 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87987e-11 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  34.49 
 
 
461 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.9773e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  34.49 
 
 
461 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.79263e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  34.49 
 
 
461 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.79304e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  34.49 
 
 
461 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  8.22499e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  34.49 
 
 
461 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  3.69558e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  34.03 
 
 
461 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.92962e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  33.26 
 
 
501 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  37.67 
 
 
461 aa  202  2e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  38 
 
 
461 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  38 
 
 
461 aa  200  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.84184e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  30.42 
 
 
498 aa  198  2e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.67951e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  29.62 
 
 
494 aa  198  2e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  31.75 
 
 
482 aa  197  5e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  34.49 
 
 
449 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.99815e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  34.49 
 
 
449 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.21919e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  30.97 
 
 
517 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  34.26 
 
 
449 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.38038e-07  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  31.09 
 
 
524 aa  194  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  30.34 
 
 
516 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  41 
 
 
464 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  40.83 
 
 
395 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.14111e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  28.6 
 
 
492 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  28.6 
 
 
492 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  33.98 
 
 
463 aa  191  3e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  33.8 
 
 
449 aa  190  6e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  38.67 
 
 
452 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  38.67 
 
 
452 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.52854e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  47.91 
 
 
539 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  47.91 
 
 
539 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  47.91 
 
 
539 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  47.91 
 
 
539 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  29.35 
 
 
501 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  30.83 
 
 
489 aa  186  1e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  30.77 
 
 
482 aa  184  2e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.40749e-05  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  30.28 
 
 
511 aa  185  2e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  28.52 
 
 
495 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.00169e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  46.34 
 
 
497 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  25.23 
 
 
500 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  25.23 
 
 
500 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>