More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6881 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  74.14 
 
 		 278 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  51.95 
 
 		 194 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  50.89 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  52.67 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  52.67 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  58.2 
 
 		 208 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  47.95 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  55.4 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  55.12 
 
 		 208 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  47.5 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  56.56 
 
 		 198 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  39.18 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  56.78 
 
 		 174 aa  125  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  60.36 
 
 		 200 aa  125  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.21 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  55.93 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  52.67 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  50.41 
 
 		 204 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  52.34 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  50.4 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  49.29 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  49.29 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  47.02 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  52.8 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  56.76 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  47.1 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  51.69 
 
 		 199 aa  119  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  50.78 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  57.26 
 
 		 300 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  48.97 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  52.8 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  52.8 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  57.26 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  52.03 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  48.36 
 
 		 191 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  44.59 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  53.1 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  57.8 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  57.8 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  56.76 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  53.39 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  49.19 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  58.88 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  46.38 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  52.89 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  57.8 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  49.11 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  42.69 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  52.68 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  53.7 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  52.68 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  46.1 
 
 		 199 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  54.39 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  46.56 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.37 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  53.04 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  57.55 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  53.28 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  51.61 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  49.57 
 
 		 245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  52.54 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  50.83 
 
 		 442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  52.54 
 
 		 188 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  49.23 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  44.16 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  55.96 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  47.24 
 
 		 206 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  52.07 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  48.36 
 
 		 197 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  48.44 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  49.19 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  42.63 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  49.58 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  51.64 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  58.65 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 146 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  46.72 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  61.76 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  46.46 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  47.93 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  54.63 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  47.93 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  35.45 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  57.55 
 
 		 318 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  46.05 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  47.11 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  45.31 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  50.88 
 
 		 154 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.32 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  56.36 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  56.36 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  45.31 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  46.83 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  47.86 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  46.4 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  57.43 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  46.4 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  47.2 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>