108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0091 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  86.98 
 
 		 459 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 411 aa  814    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  85.61 
 
 		 460 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  69.05 
 
 		 410 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  68.8 
 
 		 410 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  67.73 
 
 		 410 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  68.55 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  66.93 
 
 		 428 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  45.53 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  46.49 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  43.18 
 
 		 418 aa  289  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  44.09 
 
 		 414 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  42.03 
 
 		 401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  43.82 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  45.45 
 
 		 403 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  44.09 
 
 		 405 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  41.09 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  44.53 
 
 		 400 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  45.08 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  43.11 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  46.17 
 
 		 421 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  43.44 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  43.7 
 
 		 398 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  42.82 
 
 		 427 aa  262  6.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  43.7 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  38.7 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  41.9 
 
 		 398 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  39.18 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  43.04 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  41.03 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  42.71 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  39.02 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  39.28 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  37.76 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  36.36 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  34.02 
 
 		 415 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  36.36 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  37.53 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  36.02 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  35.38 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  35.43 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  35.56 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  30.37 
 
 		 393 aa  169  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  41.22 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  32.99 
 
 		 375 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  34.82 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  32.07 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  33.95 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  34.88 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  35.03 
 
 		 415 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  34.23 
 
 		 364 aa  150  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  33.68 
 
 		 398 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  33.95 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  33.07 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  38 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  32.75 
 
 		 385 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  31.82 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  29.33 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  36.84 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  32.78 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  32.56 
 
 		 401 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  35.8 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  30.05 
 
 		 372 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  32.14 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  32.42 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  27.66 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  27.66 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  27.41 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  31.2 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  26.75 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  24.78 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  23.11 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  28.51 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  31.33 
 
 		 460 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  30.25 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  30.72 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  22.92 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  27.13 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  25.94 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  23.61 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  29.54 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  28.28 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  27.49 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  29.11 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  31.1 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  29.2 
 
 		 482 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  27.85 
 
 		 508 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  30.72 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  29.65 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  30.99 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  26.7 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  24.77 
 
 		 468 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  49.21 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  29.27 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  46.03 
 
 		 455 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  29.27 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  29.27 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  29.93 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  29.26 
 
 		 475 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>