More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5646 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5646  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
307 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.431821  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24760  LysR family transcriptional regulator protein  68.11 
 
 
319 aa  405  1e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2076  LysR family transcriptional regulator  64.07 
 
 
309 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2720  LysR family transcriptional regulator  64.19 
 
 
296 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2952  LysR family transcriptional regulator  63.51 
 
 
296 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.845125  decreased coverage  0.00814406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2431  LysR family transcriptional regulator  64.29 
 
 
307 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557112  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3067  LysR family transcriptional regulator  65.17 
 
 
296 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436418  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3264  LysR family transcriptional regulator  63.61 
 
 
309 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.655884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1435  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  65.17 
 
 
311 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4027  transcriptional regulator, LysR family  64.9 
 
 
321 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.198411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0659  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  55.97 
 
 
307 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18200  LysR family transcriptional regulator  53.97 
 
 
306 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1579  putative transcriptional regulator  53.97 
 
 
306 aa  314  1e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3711  LysR family transcriptional regulator  54.97 
 
 
304 aa  313  2e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0755  transcriptional regulator, LysR family  55.29 
 
 
307 aa  302  4e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0668  LysR family transcriptional regulator  53.64 
 
 
309 aa  299  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2914  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
299 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2686  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
299 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1158  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
354 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3788  LysR family transcriptional regulator  47.4 
 
 
310 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0896823  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2713  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
323 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.995522  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0075  transcriptional regulator, LysR family  47.47 
 
 
304 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0067  transcriptional regulator, LysR family  47.47 
 
 
304 aa  254  1e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0396  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
304 aa  249  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3719  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
302 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0668479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2312  LysR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
302 aa  244  1e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2174  transcriptional regulator, LysR family  42.26 
 
 
331 aa  243  2e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.52777  normal  0.0251381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0511  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
301 aa  242  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.533248  hitchhiker  0.00184272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2512  transcriptional regulator, LysR family protein  40.88 
 
 
299 aa  242  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3617  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
305 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3931  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 
308 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06651  transcriptional regulator  40.61 
 
 
309 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0408  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
305 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1850  transcriptional regulator, LysR family  42.72 
 
 
331 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0195634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3879  transcriptional regulator, LysR family  44.63 
 
 
308 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.18758e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0407  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
310 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0109674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4112  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
300 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.69133e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3218  LysR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
319 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1100  LysR, substrate-binding  43.55 
 
 
307 aa  236  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4072  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
308 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.320377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3956  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
309 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3435  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
308 aa  235  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001136  transcriptional regulator  39.93 
 
 
307 aa  235  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3977  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
323 aa  232  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0402  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 
309 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0580  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 
313 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0336  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
307 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1392  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
311 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0421756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0506  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
305 aa  208  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01965  transcriptional regulator, LysR family protein  36.55 
 
 
302 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.514809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0591  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
304 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0735  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 
301 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1440  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
324 aa  199  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3695  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
303 aa  197  2e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4064  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
304 aa  196  4e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4154  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
303 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0453  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
303 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1239  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
309 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0472  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
303 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1404  transcriptional regulator, LysR family protein  34.65 
 
 
311 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3328  transcriptional regulator, LysR family  37.62 
 
 
327 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.125153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0631  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
327 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0606  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
310 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3893  LysR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
320 aa  184  1e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2720  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
310 aa  184  1e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2692  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
325 aa  184  1e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2080  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
325 aa  184  1e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2745  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
310 aa  184  2e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2609  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
310 aa  184  2e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379478  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5101  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
304 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0413  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
341 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.179367 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6020  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
310 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691555  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
303 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0592  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
310 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2359  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
310 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2439  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
310 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0726  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
310 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0227  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
310 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2719  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
310 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0891  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
310 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0712  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
310 aa  175  1e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  33.68 
 
 
306 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  38.29 
 
 
299 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1994  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
305 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
320 aa  164  1e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
304 aa  164  2e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2836  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 
306 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
301 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
301 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
301 aa  163  4e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0915  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  33.98 
 
 
311 aa  162  5e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
314 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 
301 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4453  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
302 aa  162  8e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0347042 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
301 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
307 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
301 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
310 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
305 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
306 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>