45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0054 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  85.22 
 
 
456 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  85.9 
 
 
457 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  100 
 
 
468 aa  905    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  85.04 
 
 
453 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  85.9 
 
 
457 aa  731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  85.9 
 
 
457 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  85.65 
 
 
456 aa  741    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  69.72 
 
 
469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  69.72 
 
 
469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  69.72 
 
 
469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  69.72 
 
 
469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  69.72 
 
 
469 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  69.26 
 
 
462 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  69.26 
 
 
462 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  69 
 
 
456 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  59.83 
 
 
475 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  60.25 
 
 
475 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  59.53 
 
 
459 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  36.36 
 
 
466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  34.39 
 
 
509 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  35.77 
 
 
478 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  43.94 
 
 
476 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  42.11 
 
 
476 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  27.53 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  33.16 
 
 
430 aa  63.9  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  28.51 
 
 
416 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  35.42 
 
 
419 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  32.65 
 
 
403 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  27.14 
 
 
404 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  30.86 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  32.41 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4827  type II secretion system protein  29.25 
 
 
399 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0670  general secretion pathway L  40 
 
 
409 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.216187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0649  General secretion pathway L  40 
 
 
409 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.01067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  34.38 
 
 
403 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  29.05 
 
 
435 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  23.67 
 
 
399 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  27.66 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  32.45 
 
 
425 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  31.1 
 
 
425 aa  43.9  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  37.5 
 
 
424 aa  43.9  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  44.26 
 
 
382 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  36.59 
 
 
412 aa  43.5  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  29.7 
 
 
381 aa  43.5  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3177  type II secretion system protein  24.65 
 
 
381 aa  43.5  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633159  normal  0.0234949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>