293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2868 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  72.41 
 
 
497 aa  728    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
495 aa  978    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  63.89 
 
 
498 aa  642    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  74.24 
 
 
497 aa  756    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  50.6 
 
 
498 aa  496  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  52.48 
 
 
490 aa  473  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  50.4 
 
 
499 aa  473  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  48.54 
 
 
483 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  47.72 
 
 
501 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  47.72 
 
 
501 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  46.88 
 
 
497 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  47.7 
 
 
501 aa  438  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  43.33 
 
 
482 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  41.03 
 
 
499 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  42.06 
 
 
489 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  43.01 
 
 
482 aa  365  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  42.26 
 
 
484 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  39.88 
 
 
509 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  38.48 
 
 
496 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  38.67 
 
 
486 aa  345  8e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  38.34 
 
 
497 aa  325  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  38.46 
 
 
511 aa  320  5e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  40.18 
 
 
501 aa  309  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  38.65 
 
 
517 aa  306  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  38.31 
 
 
524 aa  303  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  39.37 
 
 
498 aa  299  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  36.83 
 
 
495 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  37.67 
 
 
517 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  34.59 
 
 
507 aa  293  5e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  35.03 
 
 
462 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  35.2 
 
 
528 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  35.23 
 
 
462 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  37.92 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  37.92 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  38.11 
 
 
520 aa  286  7e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  37.04 
 
 
517 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  32.67 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  36.83 
 
 
516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  35.12 
 
 
489 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  35.38 
 
 
491 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  35.18 
 
 
490 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  34.98 
 
 
489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  34.98 
 
 
489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  36.12 
 
 
501 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  34.98 
 
 
489 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  34.62 
 
 
501 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  34.62 
 
 
501 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  33.27 
 
 
534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  34.36 
 
 
501 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  34.43 
 
 
501 aa  266  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  34.43 
 
 
451 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  33.06 
 
 
444 aa  264  3e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  33.21 
 
 
539 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  33.21 
 
 
539 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  33.21 
 
 
539 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  33.21 
 
 
539 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  34.26 
 
 
490 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  34.06 
 
 
489 aa  261  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 
432 aa  261  3e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  35.16 
 
 
516 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  35.76 
 
 
446 aa  257  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  35.76 
 
 
446 aa  257  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  35.95 
 
 
516 aa  257  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  33.72 
 
 
500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  35.33 
 
 
501 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  35.28 
 
 
527 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  34.54 
 
 
483 aa  250  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  33.82 
 
 
449 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  33.82 
 
 
449 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  33.19 
 
 
504 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  33.2 
 
 
449 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 
449 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  33.97 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  33.26 
 
 
461 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  31.24 
 
 
461 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  31.24 
 
 
461 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  31.24 
 
 
461 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  31.03 
 
 
461 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  31.24 
 
 
461 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  31.24 
 
 
461 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  31.24 
 
 
461 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  31.24 
 
 
461 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  31.24 
 
 
461 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  31.24 
 
 
461 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  32.14 
 
 
461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  31.36 
 
 
544 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  33.98 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  30.53 
 
 
463 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  31.31 
 
 
461 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  34.14 
 
 
464 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  35.01 
 
 
499 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  33.06 
 
 
477 aa  229  7e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  34.81 
 
 
395 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  33.13 
 
 
467 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  31.6 
 
 
544 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  33.64 
 
 
452 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  33.64 
 
 
452 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  32.06 
 
 
502 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3675  Dipeptide/tripeptide permease-like protein  31.3 
 
 
520 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290329  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  28.13 
 
 
566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>