More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0955 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  100 
 
 		 481 aa  951    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  39.58 
 
 		 479 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  39.58 
 
 		 479 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  35.22 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  34.4 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  34.66 
 
 		 464 aa  252  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  33.75 
 
 		 495 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  33.54 
 
 		 510 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 516 aa  229  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 509 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  36.25 
 
 		 485 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  32.46 
 
 		 484 aa  216  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  31.73 
 
 		 509 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  33.7 
 
 		 488 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  33.17 
 
 		 485 aa  203  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  30.88 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  35.64 
 
 		 497 aa  196  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 510 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 510 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 		 493 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 510 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  31.12 
 
 		 485 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 485 aa  193  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  34.2 
 
 		 498 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 490 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 		 513 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  32.07 
 
 		 497 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 527 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 		 510 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 504 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 474 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  34 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 		 492 aa  173  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  32.28 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  34.45 
 
 		 496 aa  171  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  30.8 
 
 		 504 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 521 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  23.52 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  23.52 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  22.02 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  23.57 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  30.47 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  22.83 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  25.21 
 
 		 466 aa  67  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  23.32 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  22.5 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  25.78 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  25.67 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  28.03 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  22.79 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  21.23 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 716 aa  61.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  21.01 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  25.63 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  21.16 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  25.63 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  25.63 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  25.63 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  25.63 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  26.4 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  21.16 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  21.16 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  22.12 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.96 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  25.29 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  25.8 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.15 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.15 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.15 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.15 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.15 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.15 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.16 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  25.63 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>