207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4313 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  93.38 
 
 
151 aa  258  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  93.38 
 
 
151 aa  258  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  92.72 
 
 
151 aa  256  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  92.05 
 
 
151 aa  253  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  92.05 
 
 
151 aa  253  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  90.73 
 
 
151 aa  246  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  91.03 
 
 
154 aa  239  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  88.08 
 
 
153 aa  235  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  88.08 
 
 
153 aa  235  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  88.08 
 
 
153 aa  235  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  88.08 
 
 
153 aa  235  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  88.08 
 
 
153 aa  235  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  88.08 
 
 
153 aa  235  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  78.15 
 
 
151 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  76.82 
 
 
151 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  74.83 
 
 
164 aa  208  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  86.33 
 
 
141 aa  207  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  58.74 
 
 
140 aa  150  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.48 
 
 
144 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  54.93 
 
 
143 aa  141  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.66 
 
 
144 aa  136  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.32 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.04 
 
 
148 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 
151 aa  117  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  47.52 
 
 
149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  46.67 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  46.67 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  46.67 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  46.67 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  46.67 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  46.67 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.2 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  46.67 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  46.67 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  46.67 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.68 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  53.15 
 
 
148 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.44 
 
 
137 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.33 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.67 
 
 
143 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  44.7 
 
 
143 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.06 
 
 
148 aa  103  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.44 
 
 
150 aa  102  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  43.94 
 
 
143 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  43.94 
 
 
143 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  43.94 
 
 
143 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  43.94 
 
 
143 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  43.94 
 
 
143 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  43.94 
 
 
143 aa  101  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  43.94 
 
 
143 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  43.18 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.18 
 
 
143 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.91 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  39.72 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  41.35 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.67 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  93.6  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.46 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  39.55 
 
 
138 aa  92  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.52 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  38.85 
 
 
187 aa  90.1  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.69 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.65 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.06 
 
 
173 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  87  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.65 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  42.42 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4418  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.81 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  34.81 
 
 
154 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.85 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.3 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.56 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.31 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.56 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.07 
 
 
154 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.56 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.56 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.13 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.11 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  34.97 
 
 
172 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.04 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  32.89 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.04 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  32.89 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  32.89 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  32.89 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  32.89 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.04 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.3 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  34.56 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.07 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  32.59 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  32.59 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  32 
 
 
571 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.81 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.37 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.8 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4329  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.69 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>