More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6804 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 313 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  88.18 
 
 		 309 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  91.37 
 
 		 309 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  61.69 
 
 		 299 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  61.02 
 
 		 311 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  60.68 
 
 		 311 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  60.53 
 
 		 307 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  52.32 
 
 		 303 aa  335  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  57.19 
 
 		 300 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  57.53 
 
 		 300 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  56.76 
 
 		 308 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  60 
 
 		 302 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  53 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  54.73 
 
 		 300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  58.7 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  57.88 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  52.48 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  57.88 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  59.04 
 
 		 298 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  51.66 
 
 		 302 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  52.51 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  46.75 
 
 		 305 aa  272  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  44.88 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  43.88 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  38.77 
 
 		 346 aa  199  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  36.27 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  39.75 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  37.66 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  34.62 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  35.46 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  27.08 
 
 		 1227 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.68 
 
 		 605 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  27.62 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  27.08 
 
 		 1227 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  31.27 
 
 		 818 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  26.97 
 
 		 1228 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  27.46 
 
 		 1232 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  28.03 
 
 		 1180 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0358  homocysteine S-methyltransferase, putative  26.89 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  26.18 
 
 		 1212 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  30.16 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  27.83 
 
 		 1215 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  27.3 
 
 		 1263 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  26.97 
 
 		 1228 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  27.19 
 
 		 1224 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  27.73 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  25.22 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6259  methionine synthase (B12-dependent)  26.95 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  28.27 
 
 		 1245 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.6 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  25.89 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  26.71 
 
 		 1226 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  27.02 
 
 		 806 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  25.89 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3218  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.59 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0249  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.59 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.481246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0595  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.59 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0414  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.59 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0434  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.59 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1345  B12-dependent homocysteine-N5-methyltetrahydrofolate transmethylase, repressor of metE and metF  26.59 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  30.26 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  28.99 
 
 		 804 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  30.25 
 
 		 578 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  28.83 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  26.22 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  24.42 
 
 		 1244 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  28.31 
 
 		 1168 aa  69.3  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  26.84 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2931  homocysteine S-methyltransferase  25.98 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  26.28 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  26.18 
 
 		 1223 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  29.26 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  24.42 
 
 		 1233 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  25 
 
 		 1238 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  26.28 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  26.62 
 
 		 807 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.76 
 
 		 617 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  24.93 
 
 		 1252 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  25.98 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1980  methionine synthase  26.64 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  24.13 
 
 		 1244 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2916  methionine synthase  25.98 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142976  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  27.41 
 
 		 1220 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0191  homocysteine S-methyltransferase  27.11 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  27.49 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  29.48 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0388  homocysteine S-methyltransferase  26.28 
 
 		 367 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0207088 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  27.14 
 
 		 1227 aa  67  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  23.66 
 
 		 780 aa  66.6  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  24.63 
 
 		 1244 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  25.4 
 
 		 629 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  28.48 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  24.11 
 
 		 1230 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3268  homocysteine S-methyltransferase  28.01 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  29.75 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  27.8 
 
 		 1267 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  25.3 
 
 		 1230 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  24.13 
 
 		 1244 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  25.4 
 
 		 804 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  27.38 
 
 		 1245 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>