More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5284 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  75.27 
 
 
484 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  88.77 
 
 
481 aa  818    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  100 
 
 
477 aa  942    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  97.69 
 
 
476 aa  884    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  97.69 
 
 
476 aa  884    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  74.84 
 
 
492 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  75.27 
 
 
484 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  75.33 
 
 
481 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  49.04 
 
 
476 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  49.34 
 
 
476 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  40.41 
 
 
469 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  40.18 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  34.4 
 
 
460 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  39.74 
 
 
461 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  41.07 
 
 
482 aa  253  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  40.98 
 
 
486 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  38.85 
 
 
451 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  40.14 
 
 
455 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  37.95 
 
 
485 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.21 
 
 
464 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.81 
 
 
464 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  40.78 
 
 
445 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 
464 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 
464 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  36.94 
 
 
464 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 
464 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 
464 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 
464 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 
464 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  37.73 
 
 
483 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 
464 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 
464 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  48.88 
 
 
415 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  38.7 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  35.25 
 
 
506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  47.73 
 
 
409 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  33.33 
 
 
554 aa  209  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  37.18 
 
 
495 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  35.83 
 
 
452 aa  206  8e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  47.55 
 
 
412 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  45.32 
 
 
407 aa  202  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  37.01 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.82 
 
 
471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  38.74 
 
 
449 aa  200  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  29.28 
 
 
471 aa  199  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  30.58 
 
 
498 aa  199  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  30.32 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  30.32 
 
 
492 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  38.2 
 
 
466 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  29.45 
 
 
453 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  29.45 
 
 
453 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.69 
 
 
440 aa  193  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  31 
 
 
456 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  33.33 
 
 
473 aa  187  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  47.43 
 
 
467 aa  186  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  36.52 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  40.67 
 
 
473 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  46.18 
 
 
424 aa  180  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  44.15 
 
 
465 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  39.23 
 
 
465 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  35.07 
 
 
428 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  31.98 
 
 
482 aa  177  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  41.54 
 
 
451 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  35.88 
 
 
471 aa  177  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  38.4 
 
 
386 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  31.27 
 
 
468 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  37.09 
 
 
473 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  30.37 
 
 
418 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  31.46 
 
 
395 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  33.49 
 
 
413 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  35.69 
 
 
402 aa  170  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  31.73 
 
 
475 aa  169  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  30.5 
 
 
452 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  32.69 
 
 
452 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  35.63 
 
 
391 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  30.5 
 
 
452 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  39.42 
 
 
403 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  33.15 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  30.02 
 
 
452 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  32.8 
 
 
487 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  38.49 
 
 
398 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  31.85 
 
 
452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  32.6 
 
 
414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  30.17 
 
 
477 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  33.07 
 
 
452 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  37.55 
 
 
395 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  31.28 
 
 
452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  42.91 
 
 
377 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  31.16 
 
 
452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  40.41 
 
 
484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  33.24 
 
 
452 aa  163  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  44.92 
 
 
394 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  32.13 
 
 
473 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  29.66 
 
 
452 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.52 
 
 
435 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  30.2 
 
 
406 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  39.92 
 
 
425 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  39.93 
 
 
425 aa  160  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  38.31 
 
 
435 aa  159  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  29.89 
 
 
452 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>