More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4100 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
494 aa  976  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  93.72 
 
 
494 aa  916  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  69.06 
 
 
574 aa  635  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  91.5 
 
 
494 aa  892  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  90.89 
 
 
509 aa  895  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  88.32 
 
 
495 aa  843  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
494 aa  976  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  98.38 
 
 
494 aa  962  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  68.92 
 
 
493 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
490 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  68.71 
 
 
570 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  68.92 
 
 
493 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  64.12 
 
 
490 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  62.6 
 
 
489 aa  598  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  61.52 
 
 
485 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  61.32 
 
 
485 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  58.76 
 
 
504 aa  576  1e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  59.55 
 
 
504 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
476 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  52.84 
 
 
473 aa  471  1e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.29974e-15 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  51.87 
 
 
475 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  48.86 
 
 
478 aa  460  1e-128  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
477 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
498 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  48.75 
 
 
502 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  48.58 
 
 
491 aa  399  1e-110  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.33 
 
 
488 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.31 
 
 
488 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
488 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  39.03 
 
 
477 aa  319  8e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  44.28 
 
 
496 aa  315  2e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
490 aa  306  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  38.21 
 
 
508 aa  305  9e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  2.08159e-08  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
509 aa  305  2e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
509 aa  302  8e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  7.22465e-07 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
517 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  6.15538e-06  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  38.57 
 
 
509 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  42.19 
 
 
481 aa  294  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  42.97 
 
 
501 aa  294  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
490 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
487 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 
520 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
569 aa  286  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
492 aa  286  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.45 
 
 
500 aa  285  2e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
496 aa  285  2e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  36.84 
 
 
475 aa  284  3e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.53 
 
 
472 aa  283  4e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 
492 aa  283  4e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  36.38 
 
 
501 aa  283  6e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
503 aa  283  6e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  36.34 
 
 
485 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
485 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.83 
 
 
485 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
501 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
501 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  39.21 
 
 
510 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 
470 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  34.28 
 
 
467 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.79 
 
 
497 aa  277  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
492 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.58 
 
 
497 aa  276  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.68 
 
 
472 aa  275  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
485 aa  275  1e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
492 aa  275  1e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  35.4 
 
 
520 aa  275  2e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  1.52055e-05  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
485 aa  273  4e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  36.27 
 
 
476 aa  273  4e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 
496 aa  273  5e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
493 aa  273  5e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.55 
 
 
471 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  38.69 
 
 
508 aa  273  6e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
488 aa  273  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.78 
 
 
503 aa  272  8e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
473 aa  273  8e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3667  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
494 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.13 
 
 
471 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.83 
 
 
503 aa  270  3e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
475 aa  271  3e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
491 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.11 
 
 
496 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.52 
 
 
495 aa  269  9e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.88 
 
 
501 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
486 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
493 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2017  transcriptional regulator  35.67 
 
 
505 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.70352  normal  0.217844 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  38.84 
 
 
520 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.03 
 
 
499 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  37.13 
 
 
499 aa  267  3e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  35.8 
 
 
504 aa  266  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
495 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  39.88 
 
 
515 aa  266  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.53 
 
 
464 aa  266  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  34.61 
 
 
464 aa  266  9e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
502 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
516 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  35.14 
 
 
504 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.36 
 
 
502 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
502 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.41 
 
 
495 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>