160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5723 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  60.25 
 
 
716 aa  766    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  61.13 
 
 
844 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  61.43 
 
 
756 aa  848    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  100 
 
 
745 aa  1489    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  87.52 
 
 
745 aa  1293    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  100 
 
 
745 aa  1489    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  60.99 
 
 
763 aa  831    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  60.86 
 
 
763 aa  830    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  60.13 
 
 
769 aa  827    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  60.63 
 
 
766 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  60.86 
 
 
763 aa  830    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  88.19 
 
 
745 aa  1283    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  97.58 
 
 
745 aa  1372    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  32.76 
 
 
750 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  30.93 
 
 
746 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  30.59 
 
 
762 aa  356  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  34.65 
 
 
752 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  33.11 
 
 
749 aa  352  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  35.41 
 
 
757 aa  352  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  30.08 
 
 
769 aa  337  5e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  33.64 
 
 
752 aa  333  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  35.74 
 
 
727 aa  301  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  35.23 
 
 
736 aa  283  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  27.74 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  23.8 
 
 
649 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  23.84 
 
 
649 aa  125  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  23.84 
 
 
649 aa  125  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  23.45 
 
 
649 aa  124  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  23.35 
 
 
649 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  33.42 
 
 
436 aa  122  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  22.99 
 
 
649 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  22.99 
 
 
649 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  22.82 
 
 
649 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  23.17 
 
 
649 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  22.52 
 
 
649 aa  119  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  31.05 
 
 
404 aa  112  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  25.84 
 
 
630 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  27.69 
 
 
644 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  27.72 
 
 
669 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  24.01 
 
 
650 aa  107  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  26.52 
 
 
630 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  26.41 
 
 
628 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  27.22 
 
 
403 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  24.08 
 
 
647 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  26.63 
 
 
424 aa  101  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  25.1 
 
 
607 aa  101  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  27.93 
 
 
575 aa  99  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  25.81 
 
 
641 aa  95.9  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  29.39 
 
 
406 aa  95.9  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  27.45 
 
 
426 aa  94  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  29.15 
 
 
403 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  26.9 
 
 
647 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  23.61 
 
 
437 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  27.75 
 
 
404 aa  92  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  27.53 
 
 
403 aa  91.7  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  29.94 
 
 
389 aa  90.9  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  28.24 
 
 
403 aa  89.4  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  27.33 
 
 
584 aa  87.8  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  26.38 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  33.91 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  29.6 
 
 
572 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  27.07 
 
 
403 aa  83.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  25.97 
 
 
400 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  27.64 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  27.35 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  28.53 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  29.92 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  27.97 
 
 
391 aa  79  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  28.77 
 
 
582 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  26.08 
 
 
644 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  25.77 
 
 
566 aa  77.4  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  28.41 
 
 
572 aa  77.4  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  30.43 
 
 
585 aa  74.7  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  29.85 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  26.72 
 
 
404 aa  73.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  30.04 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  25.92 
 
 
575 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  27.21 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  27.35 
 
 
466 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  26.25 
 
 
353 aa  63.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  26.74 
 
 
584 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  25.85 
 
 
580 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  39.83 
 
 
420 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  27.2 
 
 
439 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  29.27 
 
 
405 aa  58.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  25.68 
 
 
600 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  25 
 
 
555 aa  56.6  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  24.19 
 
 
587 aa  55.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  26.29 
 
 
396 aa  55.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  22.07 
 
 
728 aa  54.7  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  25.4 
 
 
618 aa  54.7  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  27.31 
 
 
592 aa  54.3  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  21.92 
 
 
729 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  26.67 
 
 
587 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  21.92 
 
 
728 aa  53.9  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  21.37 
 
 
728 aa  53.9  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  22.35 
 
 
729 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  31.78 
 
 
604 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  21.92 
 
 
729 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  21.92 
 
 
729 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>