More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3675 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3675  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 447 aa  899    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.74 
 
 		 434 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  31 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.5 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.62 
 
 		 426 aa  93.2  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.13 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.14 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.14 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  28.04 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3472  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.03 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  21.61 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.25 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.65 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.14 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 438 aa  67  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.59 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.06 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  21.96 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.73 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  24.45 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1115  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000327347  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.01 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.19 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3858  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000022263  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.18 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  19.75 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0237  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>