More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5009 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  99.36 
 
 		 155 aa  308  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  91.39 
 
 		 155 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  91.72 
 
 		 155 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  91.72 
 
 		 155 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  91.72 
 
 		 155 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  86.9 
 
 		 158 aa  258  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  76.16 
 
 		 155 aa  244  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  76.16 
 
 		 155 aa  244  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  76.16 
 
 		 155 aa  244  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  76.16 
 
 		 155 aa  244  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  76.16 
 
 		 155 aa  244  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  76.16 
 
 		 155 aa  244  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  75.5 
 
 		 155 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  63.87 
 
 		 155 aa  208  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  63.23 
 
 		 155 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  59.6 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  57.14 
 
 		 168 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  55.1 
 
 		 187 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  51.37 
 
 		 167 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  50.34 
 
 		 168 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  52.74 
 
 		 163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  51.7 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  46.79 
 
 		 164 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  52.05 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  50.64 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  43.05 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  40 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  40 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  43.75 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  41.29 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  46.79 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  46.79 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  46.79 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  46.79 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  46.79 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  46.79 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  46.26 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  46.26 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  43.87 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  39.31 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  40.69 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  40.26 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  43.84 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  38.41 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  39.31 
 
 		 200 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  40 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  40 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  38.56 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  39.31 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  37.93 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  40.82 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  41.14 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 157 aa  97.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  40.27 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  36.55 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  39.61 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  39.61 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  38.62 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  38.62 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  38.62 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  38.62 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  38.62 
 
 		 200 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  38.62 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  42.58 
 
 		 173 aa  94.4  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  39.86 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  35.17 
 
 		 164 aa  90.9  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  38.62 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  37.93 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  33.1 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  39.61 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  38.62 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  39.04 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  36.54 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  36.18 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  36.6 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  37.18 
 
 		 187 aa  84  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  37.33 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.17 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  37.74 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  38.22 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  35.57 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  38.78 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>