141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3658 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  100 
 
 		 374 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  42.06 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  40.4 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  36.49 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  40.11 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  38.7 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  38.98 
 
 		 361 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  37.16 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0636  hypothetical protein  41.03 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  31.25 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  31.54 
 
 		 338 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  29.59 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  28.27 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  26.65 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  28.11 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  31.31 
 
 		 338 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  27.98 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  29.79 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  29.43 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  29.43 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.68 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  25.39 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.15 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  25.66 
 
 		 356 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  25.39 
 
 		 356 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  27.67 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.68 
 
 		 344 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.14 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.46 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  27.1 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  27.1 
 
 		 356 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  27.1 
 
 		 356 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  26.42 
 
 		 317 aa  96.7  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  29.45 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  26.36 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  27.02 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  26.21 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.53 
 
 		 388 aa  92.8  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  26.21 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  27.4 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  27.24 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  27.27 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  27.78 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  25.96 
 
 		 308 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  28.06 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  26.71 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.48 
 
 		 359 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  27.35 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  28.08 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  25.95 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  29.28 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  23.3 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  26.38 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  28.85 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  27.8 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  23.79 
 
 		 309 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  26.33 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  27.45 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  29.02 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  26.86 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  29.18 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  29.18 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  26.18 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  25.25 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  24.66 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  26.68 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  23.97 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  26.33 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  24.86 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  25.41 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  25.82 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  28 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000026  hypothetical protein  25.83 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  26.13 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  26.13 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  26.13 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  26.13 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  26.13 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  26.13 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  24.32 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  27.15 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  31.9 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  26.13 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  26.07 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  24.32 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  31.86 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  31.86 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  28.19 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  31.86 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  31.86 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  31.86 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  26.43 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  31.86 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  24.19 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.17 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  26.76 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.65 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  28.14 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.16 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  25.23 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>