242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1202 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  93.46 
 
 		 306 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  58.16 
 
 		 315 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  55.33 
 
 		 295 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  54.98 
 
 		 295 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  55.82 
 
 		 305 aa  320  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  50.84 
 
 		 316 aa  295  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  43.66 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  51.16 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  46.79 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  43 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  39.93 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  39.8 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 296 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  36.16 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  33.97 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  34.44 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  35.08 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.37 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  44.76 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  34.39 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  32.52 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  34.05 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  33.33 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  30.67 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  32.97 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  32.64 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  29 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  32.28 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  28.57 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  27.49 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  27.49 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  27.72 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  37.06 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  33.49 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  27.49 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  34.88 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  34.51 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  32 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  32.12 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  31.2 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  29.14 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  30.4 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  29.86 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  30.5 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  32.8 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  33.65 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  31.2 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  29.6 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  30.4 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  30.43 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  30.25 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  35.35 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  27.34 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  31.11 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  29.6 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  33.59 
 
 		 876 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  29.46 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  29.46 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  31.09 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  29.41 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  27.78 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.59 
 
 		 866 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  30.16 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  28.68 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  28.68 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  28.68 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  28.68 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  28.36 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  28.68 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  32.17 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  30.17 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  34.34 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  28.69 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  31.91 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  27.98 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  27.86 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  30.53 
 
 		 868 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  32.17 
 
 		 378 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  33.61 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  30.47 
 
 		 355 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  29.41 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.93 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>