More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1653 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  98.75 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  98.12 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  98.75 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  98.75 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  98.73 
 
 		 157 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  90.51 
 
 		 158 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  78.38 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  78.38 
 
 		 157 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  78.91 
 
 		 167 aa  238  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  78.38 
 
 		 156 aa  237  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  78.38 
 
 		 156 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  78.38 
 
 		 156 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  78.23 
 
 		 152 aa  234  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  74.32 
 
 		 149 aa  231  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  74.32 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  72.6 
 
 		 149 aa  225  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  59.31 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  57.14 
 
 		 153 aa  170  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  57.93 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 146 aa  134  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.17 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  50.82 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  51.67 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  34.56 
 
 		 399 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  42.42 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  40.74 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  40.74 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  39.36 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  36.99 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  37.37 
 
 		 570 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  36.99 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  28.86 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  31.3 
 
 		 255 aa  54.3  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  34.38 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  31.58 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  33.87 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  31.58 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  38.3 
 
 		 430 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0573  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.78 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.454249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  32.29 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  37.93 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2393  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.41 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.783924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  32.29 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  34.51 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.75 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.75 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.75 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 		 230 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  42.47 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  39.13 
 
 		 132 aa  51.2  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  24.62 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  24.62 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  36.78 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0542  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase  26.17 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.411915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 132 aa  50.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.75 
 
 		 175 aa  50.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  30.21 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  30.21 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  30.21 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0516  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.41 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.108203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>