263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0744 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  100 
 
 
385 aa  779  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  99.74 
 
 
385 aa  776  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  95.06 
 
 
385 aa  744  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  67.72 
 
 
383 aa  563  1e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  66.84 
 
 
384 aa  561  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  70.37 
 
 
392 aa  558  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  67.19 
 
 
381 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  66.4 
 
 
381 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  57.85 
 
 
382 aa  458  1e-128  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0869  ribonuclease D  55.87 
 
 
391 aa  445  1e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  56.88 
 
 
405 aa  441  1e-122  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  54.71 
 
 
382 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  54.97 
 
 
382 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  53.93 
 
 
392 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  54.81 
 
 
384 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  53.4 
 
 
392 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  56.46 
 
 
395 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  53.93 
 
 
388 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  54.97 
 
 
396 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  54.5 
 
 
384 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  54.69 
 
 
384 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  54.69 
 
 
384 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  55.47 
 
 
427 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  51.81 
 
 
386 aa  395  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  4.81962e-05 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  54.45 
 
 
394 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  53.37 
 
 
389 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  55.04 
 
 
384 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  50.4 
 
 
386 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3068  ribonuclease D  47.29 
 
 
385 aa  353  3e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1971  ribonuclease D  47.29 
 
 
385 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0679  ribonuclease D  47.29 
 
 
385 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  47.29 
 
 
385 aa  353  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  46.7 
 
 
393 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  45.83 
 
 
395 aa  346  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  46.61 
 
 
386 aa  343  3e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  47.66 
 
 
392 aa  342  6e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  50.96 
 
 
389 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  45.74 
 
 
385 aa  339  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1890  ribonuclease D  43.59 
 
 
401 aa  325  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239057  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  42.56 
 
 
405 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  43.27 
 
 
395 aa  303  4e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  38.75 
 
 
392 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  34.73 
 
 
396 aa  236  5e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  34.12 
 
 
392 aa  233  6e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  35.42 
 
 
388 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  34.4 
 
 
399 aa  214  2e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  1.84069e-07  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  34.34 
 
 
392 aa  210  4e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  35 
 
 
379 aa  209  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  35.8 
 
 
381 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  33.69 
 
 
377 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  33.87 
 
 
377 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  33.69 
 
 
377 aa  190  3e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  31.99 
 
 
379 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  31.3 
 
 
369 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0507  ribonuclease D  31.44 
 
 
374 aa  186  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  31.02 
 
 
369 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.59973e-05  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  31.02 
 
 
369 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  31.02 
 
 
369 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.12189e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  33.33 
 
 
377 aa  185  1e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  34.18 
 
 
377 aa  185  1e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  31.61 
 
 
377 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0672  Ribonuclease D  33.33 
 
 
423 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  30.89 
 
 
367 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  30.47 
 
 
368 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.20269e-07  hitchhiker  3.05333e-05 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  31.48 
 
 
387 aa  175  1e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  31.62 
 
 
382 aa  175  1e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  30.34 
 
 
367 aa  174  2e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  6.18336e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  31 
 
 
375 aa  174  3e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  31 
 
 
375 aa  174  3e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  31 
 
 
375 aa  174  3e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  31.13 
 
 
370 aa  173  4e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  31 
 
 
375 aa  173  6e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  31 
 
 
375 aa  173  6e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  31 
 
 
375 aa  173  6e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  30.46 
 
 
375 aa  172  7e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1461  ribonuclease D  32.97 
 
 
375 aa  172  8e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  31 
 
 
371 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.15292e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2402  ribonuclease D  31.48 
 
 
373 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.37804e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  31.52 
 
 
377 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2013  ribonuclease D  31.48 
 
 
373 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.28628e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  30.35 
 
 
388 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  5.746e-08  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2124  ribonuclease D  31.48 
 
 
373 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0137564  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  30.35 
 
 
384 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.67525e-08  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  31.52 
 
 
377 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  30.35 
 
 
384 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.77901e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  31.05 
 
 
386 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  30.54 
 
 
371 aa  170  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2232  ribonuclease D  31.66 
 
 
374 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.42967e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  29.57 
 
 
386 aa  169  5e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  30.54 
 
 
371 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  32 
 
 
381 aa  169  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.4851e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  30.85 
 
 
369 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  4.46325e-06  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1937  ribonuclease D  31.3 
 
 
374 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  35.88 
 
 
385 aa  166  7e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  7.96428e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  30.81 
 
 
388 aa  166  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.136e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  30.22 
 
 
369 aa  165  1e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.80385e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  31.48 
 
 
374 aa  163  5e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  32.94 
 
 
358 aa  162  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  30.05 
 
 
375 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.19147e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  30.05 
 
 
375 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  7.40588e-05  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>