More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0978 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  100 
 
 		 768 aa  1590    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  57.29 
 
 		 773 aa  880    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  40.96 
 
 		 784 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  39.53 
 
 		 765 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.1 
 
 		 821 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  38.78 
 
 		 807 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.04 
 
 		 763 aa  412  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  36.05 
 
 		 833 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  37.83 
 
 		 838 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  34.82 
 
 		 801 aa  342  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  34.57 
 
 		 789 aa  336  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  34.64 
 
 		 773 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  34.45 
 
 		 821 aa  333  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  31.93 
 
 		 772 aa  328  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  32.12 
 
 		 727 aa  324  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  34.64 
 
 		 892 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  33.33 
 
 		 740 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 		 766 aa  314  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 		 723 aa  312  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 		 759 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  33.48 
 
 		 1057 aa  308  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.39 
 
 		 727 aa  303  8.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 737 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 820 aa  296  8e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  31.31 
 
 		 744 aa  291  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 		 807 aa  289  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  31.63 
 
 		 739 aa  284  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 758 aa  283  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.1 
 
 		 817 aa  282  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 758 aa  279  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 		 736 aa  276  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  30.54 
 
 		 721 aa  276  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 819 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  32.6 
 
 		 880 aa  268  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 		 801 aa  264  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 		 747 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  32.14 
 
 		 680 aa  259  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  33.13 
 
 		 726 aa  258  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 871 aa  253  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  30.01 
 
 		 771 aa  247  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  29.98 
 
 		 710 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  30.32 
 
 		 830 aa  243  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  30.76 
 
 		 693 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 877 aa  241  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.36 
 
 		 766 aa  241  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 816 aa  240  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 710 aa  240  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  31.29 
 
 		 710 aa  239  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 816 aa  239  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 816 aa  239  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 705 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 700 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  31.94 
 
 		 814 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 703 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 817 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 818 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 		 695 aa  225  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 828 aa  225  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 824 aa  221  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 831 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  30.99 
 
 		 761 aa  219  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 830 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  30.51 
 
 		 723 aa  219  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 831 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  30.13 
 
 		 810 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  27.81 
 
 		 751 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 		 761 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.48 
 
 		 720 aa  211  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  29.51 
 
 		 905 aa  209  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  28.89 
 
 		 764 aa  208  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  28.85 
 
 		 750 aa  207  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  30.47 
 
 		 829 aa  204  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  31.08 
 
 		 710 aa  203  8e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  30.05 
 
 		 722 aa  203  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.07 
 
 		 840 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  29.86 
 
 		 825 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  32.19 
 
 		 704 aa  202  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  27.98 
 
 		 681 aa  198  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  27.52 
 
 		 806 aa  196  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  28.84 
 
 		 836 aa  193  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  27.76 
 
 		 648 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  27.29 
 
 		 683 aa  192  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  28.32 
 
 		 648 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.45 
 
 		 816 aa  191  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  27.72 
 
 		 683 aa  191  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  27.05 
 
 		 683 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  26.89 
 
 		 683 aa  189  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 		 725 aa  187  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  28.8 
 
 		 708 aa  187  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  26.73 
 
 		 683 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  26.57 
 
 		 683 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  28.2 
 
 		 759 aa  184  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  26.73 
 
 		 683 aa  184  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  26.73 
 
 		 683 aa  184  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 778 aa  183  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  28.77 
 
 		 794 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 695 aa  182  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  26.89 
 
 		 683 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  26.57 
 
 		 683 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>