More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A1353 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
218 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  99.54 
 
 
218 aa  441  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  98.62 
 
 
218 aa  437  1e-122  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  98.62 
 
 
218 aa  437  1e-122  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  98.62 
 
 
218 aa  437  1e-122  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  98.62 
 
 
218 aa  439  1e-122  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  98.62 
 
 
218 aa  437  1e-122  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  98.62 
 
 
218 aa  439  1e-122  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  98.17 
 
 
218 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  95.41 
 
 
218 aa  424  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  91.08 
 
 
215 aa  397  1e-110  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  58.57 
 
 
238 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  58.1 
 
 
241 aa  250  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  39.91 
 
 
240 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  43 
 
 
239 aa  158  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  40.95 
 
 
239 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  37.61 
 
 
245 aa  151  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.85286e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  40.48 
 
 
241 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  37.98 
 
 
240 aa  144  8e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
233 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
268 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 
249 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  36.59 
 
 
249 aa  120  1e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
274 aa  120  2e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
241 aa  118  8e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  8.58772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
248 aa  117  1e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 
249 aa  116  2e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
251 aa  115  4e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  36.54 
 
 
272 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
232 aa  115  7e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.75173e-12  decreased coverage  2.35359e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 
249 aa  114  8e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
254 aa  114  9e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 
249 aa  114  9e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
272 aa  114  1e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  34.95 
 
 
273 aa  113  2e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  9.57079e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 
268 aa  113  2e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
253 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
247 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  34.15 
 
 
249 aa  111  7e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 
249 aa  111  7e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 
249 aa  111  7e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  33.81 
 
 
239 aa  111  7e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  32.72 
 
 
254 aa  111  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
249 aa  110  1e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  31.46 
 
 
254 aa  110  1e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  32.26 
 
 
254 aa  110  2e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
270 aa  110  2e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  33.5 
 
 
240 aa  110  2e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  33.98 
 
 
229 aa  110  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  31.46 
 
 
254 aa  110  2e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 
253 aa  110  2e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.5 
 
 
239 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.63165e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  31.92 
 
 
278 aa  108  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  31.92 
 
 
254 aa  108  8e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  33.5 
 
 
240 aa  108  8e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  31.92 
 
 
254 aa  108  8e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.06 
 
 
250 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  34.88 
 
 
273 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  32.08 
 
 
254 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
255 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 
261 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 
253 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.76 
 
 
231 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 
253 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  33.18 
 
 
254 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  33.18 
 
 
254 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  33.18 
 
 
254 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  31.92 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  32.52 
 
 
243 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  31.92 
 
 
254 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  31.92 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  31.92 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  31.92 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.50379e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  31.92 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  33.18 
 
 
254 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  31.92 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  31.92 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  6.5438e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  33.18 
 
 
254 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  31.92 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  32.06 
 
 
258 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 
226 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  32.39 
 
 
254 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  37.38 
 
 
248 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
255 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  32.84 
 
 
254 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 
250 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  33.5 
 
 
229 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  31.03 
 
 
228 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  28.77 
 
 
242 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  31.53 
 
 
228 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.81 
 
 
259 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  31.82 
 
 
263 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
261 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  33.02 
 
 
248 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
251 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
231 aa  101  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  35.75 
 
 
252 aa  101  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
256 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  32.55 
 
 
251 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 
238 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>