96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A5529 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  100 
 
 
285 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  90.88 
 
 
285 aa  533  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  87.37 
 
 
285 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  85.61 
 
 
285 aa  497  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  85.26 
 
 
285 aa  495  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  85.26 
 
 
285 aa  495  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  84.21 
 
 
285 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  71.63 
 
 
287 aa  418  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  70.57 
 
 
288 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  93.43 
 
 
213 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  30.04 
 
 
292 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  28.9 
 
 
297 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  28.89 
 
 
294 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  28.89 
 
 
294 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  28.89 
 
 
294 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  28.89 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  28.89 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  29.68 
 
 
292 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  29.71 
 
 
294 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  28.14 
 
 
297 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  27.08 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  30.04 
 
 
298 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  28.52 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  23.9 
 
 
435 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  25.93 
 
 
436 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  27.12 
 
 
421 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  27.12 
 
 
421 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  41.51 
 
 
423 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  37.33 
 
 
301 aa  52.8  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  33.65 
 
 
107 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 
422 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 
106 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  27.84 
 
 
424 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
173 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
197 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  27.72 
 
 
423 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  27.7 
 
 
427 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  35 
 
 
404 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  27.72 
 
 
423 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  29.25 
 
 
425 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  27.14 
 
 
423 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 
176 aa  46.6  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  33.64 
 
 
366 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 
112 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 
188 aa  46.6  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2859  helix-turn-helix domain-containing protein  25.69 
 
 
316 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000554172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  33.33 
 
 
419 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  29.79 
 
 
421 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 
174 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  24.69 
 
 
313 aa  45.8  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  33.33 
 
 
424 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 
419 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  31.75 
 
 
419 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  35.53 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  31.75 
 
 
422 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 
189 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  27.4 
 
 
433 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 
110 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  31.75 
 
 
422 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  31.75 
 
 
426 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  28.17 
 
 
182 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  28.17 
 
 
182 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
432 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 
161 aa  43.5  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1821  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 
650 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 
187 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  32.06 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
198 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 
182 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  28.17 
 
 
182 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  44.23 
 
 
403 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  44.23 
 
 
403 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  45.1 
 
 
403 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  45.1 
 
 
403 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  45.1 
 
 
403 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 
131 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  45.1 
 
 
403 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 
182 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  45.1 
 
 
403 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  26.56 
 
 
199 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  24 
 
 
191 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
152 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  37.1 
 
 
142 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
218 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  44.23 
 
 
404 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  33.8 
 
 
88 aa  42.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
189 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  24 
 
 
191 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  37.7 
 
 
178 aa  42.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 
182 aa  42.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  26.76 
 
 
182 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>