38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0478 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0897  helix-turn-helix domain-containing protein  30.06 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354473  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0793  XRE family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2039  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  25.41 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  26.02 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  25.4 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  26.02 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  23.97 
 
 		 313 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  34.62 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  23.11 
 
 		 421 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  23.11 
 
 		 421 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  35.06 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  35.06 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  35.06 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  35.06 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  24.7 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  24.83 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  32.43 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 110 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 503 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>