27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2859 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2859  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  645    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000554172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  24.2 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  24.05 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  25.44 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  22.88 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  22.88 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  22.88 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  22.88 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  22.88 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  22.6 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  22.55 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  22.26 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  22.64 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  23.1 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  23.24 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  23.24 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  26.47 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  26.39 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  25.69 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  26.57 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  24.27 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  24.27 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  25.69 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  24.76 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 3035 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>