More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5234 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  74.3 
 
 
250 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  73.09 
 
 
250 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  72.69 
 
 
250 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  71.08 
 
 
250 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  74.3 
 
 
250 aa  358  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  69.2 
 
 
251 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  60.47 
 
 
254 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  58.1 
 
 
254 aa  295  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  56.3 
 
 
255 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  55.42 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  58.13 
 
 
261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  56.97 
 
 
254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  53.23 
 
 
261 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  50.79 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  51.56 
 
 
257 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  54.66 
 
 
251 aa  262  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  52.85 
 
 
256 aa  260  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  52.42 
 
 
261 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  52.44 
 
 
256 aa  258  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  51.75 
 
 
258 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  52.14 
 
 
258 aa  251  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  48.98 
 
 
257 aa  250  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  51.84 
 
 
256 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  53.04 
 
 
261 aa  244  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  43.72 
 
 
248 aa  195  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  38.2 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  34.06 
 
 
243 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
268 aa  111  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  37.55 
 
 
262 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
272 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  30.28 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
257 aa  92  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.76 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  28.34 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  28.97 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
250 aa  81.6  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  28.46 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.48 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
267 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.45 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.97 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  28.63 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  35.75 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 
273 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.71 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.03 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
277 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.58 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.39 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.17 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  26.14 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  28.76 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.43 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  28 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  35.45 
 
 
265 aa  72  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 
283 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
275 aa  72  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  27.14 
 
 
296 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  27.14 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  27.7 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.81 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  27.51 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.08 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  42.45 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  27.14 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.38 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  43.88 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>