154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26620 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  663    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  56.89 
 
 
367 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  54.97 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  57.01 
 
 
427 aa  339  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  51.22 
 
 
488 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  53.38 
 
 
357 aa  309  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  47.69 
 
 
388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  48 
 
 
366 aa  282  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  48.88 
 
 
349 aa  279  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  49.37 
 
 
336 aa  272  7e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  49.22 
 
 
377 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  43.04 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  43.95 
 
 
348 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  44.27 
 
 
348 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  45.31 
 
 
361 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  45.31 
 
 
361 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  45.31 
 
 
361 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  45.31 
 
 
361 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  45.31 
 
 
361 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  45.31 
 
 
361 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  40.12 
 
 
370 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  42.77 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  42.26 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  44.22 
 
 
353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  41.1 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  43.71 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  42.63 
 
 
351 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  42.19 
 
 
358 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  41.69 
 
 
349 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  42.05 
 
 
349 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  42.05 
 
 
349 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  42.05 
 
 
349 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  42.41 
 
 
358 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  42.32 
 
 
361 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  39.93 
 
 
346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  38.24 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  38.24 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  37.74 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  39.93 
 
 
311 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  41.11 
 
 
341 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  40.77 
 
 
341 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  40.77 
 
 
341 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  37.85 
 
 
352 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  63.45 
 
 
492 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  63.45 
 
 
492 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  63.45 
 
 
492 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  63.45 
 
 
481 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  63.45 
 
 
492 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  63.45 
 
 
456 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.66 
 
 
344 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  35.19 
 
 
356 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.35 
 
 
343 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  33.95 
 
 
356 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.95 
 
 
385 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  34.57 
 
 
356 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  34.57 
 
 
356 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  34.57 
 
 
356 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.9 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  32.03 
 
 
330 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  35.96 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.28 
 
 
332 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  31.58 
 
 
363 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  32.29 
 
 
366 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  32.29 
 
 
366 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  32.29 
 
 
366 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  32.29 
 
 
366 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  32.29 
 
 
366 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  32.29 
 
 
366 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  32.29 
 
 
366 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.89 
 
 
332 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.98 
 
 
337 aa  122  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  31.7 
 
 
366 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  28.62 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  31.32 
 
 
366 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  30.82 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  31.44 
 
 
366 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  31.44 
 
 
366 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  31.16 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.12 
 
 
364 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  30.53 
 
 
366 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  31.07 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  30.88 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  33.86 
 
 
338 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3560  type VI secretion protein  27.7 
 
 
327 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  27.7 
 
 
327 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  27.7 
 
 
327 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  32.41 
 
 
332 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  32.41 
 
 
332 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  28.09 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  29.44 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  27.08 
 
 
337 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  33.84 
 
 
340 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  27.68 
 
 
332 aa  95.9  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  25.66 
 
 
356 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  25.66 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3031  hypothetical protein  31.67 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586945  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0443  hypothetical protein  30.47 
 
 
329 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2079  hypothetical protein  30.47 
 
 
329 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0744  hypothetical protein  30.47 
 
 
329 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1039  hypothetical protein  30.47 
 
 
329 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>