More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0448 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
197 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  85.71 
 
 
198 aa  320  7e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  73.85 
 
 
211 aa  294  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  79.56 
 
 
210 aa  284  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  61.17 
 
 
207 aa  238  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  57.65 
 
 
214 aa  235  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  58.76 
 
 
208 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  60.66 
 
 
206 aa  228  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  58.66 
 
 
205 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  58.66 
 
 
205 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  54.4 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  44.5 
 
 
201 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  48.28 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  44.32 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  45.05 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  43.78 
 
 
200 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  44.32 
 
 
200 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  45.16 
 
 
204 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  43.65 
 
 
209 aa  159  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  43.46 
 
 
206 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  43.78 
 
 
200 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  40.3 
 
 
201 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  44.15 
 
 
208 aa  157  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  43.62 
 
 
200 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  40.3 
 
 
201 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  43.85 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  42.08 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  41.29 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  38.89 
 
 
197 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  38.89 
 
 
197 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  38.38 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  38.38 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  38.38 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  43.17 
 
 
198 aa  134  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  38.5 
 
 
205 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  37.37 
 
 
203 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  38.69 
 
 
217 aa  129  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  38.76 
 
 
212 aa  129  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  41.01 
 
 
181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  39.13 
 
 
220 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  37.88 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  37.88 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  38.59 
 
 
220 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  37.84 
 
 
208 aa  124  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  39.44 
 
 
219 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  39.55 
 
 
180 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  38.92 
 
 
283 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  40.38 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  39.25 
 
 
229 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  36.74 
 
 
224 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  36.5 
 
 
205 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  33.97 
 
 
215 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  39.74 
 
 
291 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  39.74 
 
 
291 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  35.81 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  40.38 
 
 
291 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  40.38 
 
 
291 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  40.11 
 
 
222 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  40.38 
 
 
291 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  40.38 
 
 
291 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  35.14 
 
 
206 aa  118  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  39.46 
 
 
205 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  34.9 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  39.06 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  35.1 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  34.45 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  35.87 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  36.15 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  38.38 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  35.29 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  41.29 
 
 
294 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  36.92 
 
 
215 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  37.96 
 
 
213 aa  115  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  39.04 
 
 
222 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  39.1 
 
 
291 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  37.78 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  36.61 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  34.39 
 
 
223 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  38.46 
 
 
291 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  37.19 
 
 
211 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  35.96 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  37.19 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  32.52 
 
 
291 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  38.5 
 
 
217 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  39.44 
 
 
319 aa  111  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  34.7 
 
 
293 aa  111  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  31.55 
 
 
291 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  38.46 
 
 
291 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  41.67 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  31.09 
 
 
304 aa  109  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  33.63 
 
 
293 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  33.01 
 
 
291 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  33.63 
 
 
244 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  36.51 
 
 
298 aa  108  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  38.46 
 
 
293 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  33.63 
 
 
293 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  35.24 
 
 
293 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 
293 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  40.69 
 
 
296 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  33.78 
 
 
293 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>