More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3133 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  77.48 
 
 		 487 aa  731    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  100 
 
 		 462 aa  926    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  45.06 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  43.72 
 
 		 469 aa  299  9e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  46.17 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  41.72 
 
 		 428 aa  282  7.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  41.09 
 
 		 415 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  42.67 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  41.04 
 
 		 475 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  42.33 
 
 		 409 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  42.76 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  44.37 
 
 		 433 aa  264  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  41.65 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  42.15 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  39.62 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  39.4 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  36.3 
 
 		 435 aa  219  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  36.98 
 
 		 425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.89 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.64 
 
 		 445 aa  176  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  35.64 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  39.93 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.68 
 
 		 464 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  36.96 
 
 		 398 aa  169  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  31.96 
 
 		 483 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  36.23 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.6 
 
 		 464 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.6 
 
 		 464 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.54 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.54 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.6 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.6 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.6 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.6 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  27.71 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  32.05 
 
 		 467 aa  163  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  29.57 
 
 		 461 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  31.3 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  36.1 
 
 		 399 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  39.56 
 
 		 401 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  32.11 
 
 		 451 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  37.5 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  35.48 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  28.08 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  41.85 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  35.74 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  35.84 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  35.84 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  35.48 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  38.04 
 
 		 482 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.62 
 
 		 476 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  35.13 
 
 		 399 aa  156  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  37.87 
 
 		 485 aa  156  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  35.48 
 
 		 399 aa  156  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.78 
 
 		 481 aa  156  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  35.56 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  34.77 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  32.49 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  31.82 
 
 		 455 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  33.81 
 
 		 395 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.91 
 
 		 476 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.91 
 
 		 476 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  34.41 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  40 
 
 		 394 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  35.74 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.66 
 
 		 476 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  40.23 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  26.65 
 
 		 498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.46 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  33.7 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  33.09 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  32.82 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  36.53 
 
 		 403 aa  147  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  35.42 
 
 		 465 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.28 
 
 		 481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  30.92 
 
 		 495 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  30.04 
 
 		 456 aa  146  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  28.82 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  38.06 
 
 		 376 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  30.26 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  30.26 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.5 
 
 		 484 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  37.65 
 
 		 383 aa  143  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.5 
 
 		 484 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  33.57 
 
 		 395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.14 
 
 		 492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  31.77 
 
 		 492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  31.77 
 
 		 492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  34.33 
 
 		 484 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  29.11 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  37.5 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  35.66 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  38.85 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  37.16 
 
 		 397 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  35.45 
 
 		 469 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  37.04 
 
 		 503 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  33.79 
 
 		 391 aa  140  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  35.9 
 
 		 377 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  35.25 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  35.25 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>