252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0435 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
190 aa  394  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.05 
 
 
188 aa  207  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  45.79 
 
 
199 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45.79 
 
 
188 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  45.79 
 
 
188 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.92 
 
 
186 aa  156  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  45.26 
 
 
188 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.7 
 
 
187 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.32 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
187 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.09 
 
 
187 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.55 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  38.97 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.68 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  39.57 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.1 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.4 
 
 
187 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.21 
 
 
188 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.42 
 
 
199 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  36.9 
 
 
182 aa  121  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  48.3 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.18 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  41.62 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.22 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.97 
 
 
186 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  37.82 
 
 
183 aa  111  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  36.98 
 
 
178 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  38.17 
 
 
187 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.9 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  35.6 
 
 
181 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  38.38 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
183 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  34.04 
 
 
185 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.38 
 
 
176 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.02 
 
 
184 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.1 
 
 
176 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.83 
 
 
180 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  34.22 
 
 
180 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.65 
 
 
182 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.36 
 
 
189 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
185 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.57 
 
 
185 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.22 
 
 
187 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.57 
 
 
178 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.04 
 
 
182 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  35.68 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.35 
 
 
201 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.56 
 
 
188 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  34.92 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  37.42 
 
 
182 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  34.39 
 
 
181 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.3 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  34.92 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.68 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  36.32 
 
 
178 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  37.28 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.22 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 
177 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
183 aa  92  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
200 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.6 
 
 
178 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
183 aa  91.3  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  35.42 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.82 
 
 
221 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.86 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  35.32 
 
 
221 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.32 
 
 
221 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
181 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.63 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  34.55 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  36.08 
 
 
184 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  36.17 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  33.77 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
194 aa  84.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  35.94 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.55 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  32.34 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.83 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.16 
 
 
217 aa  81.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.5 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.66 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  32.65 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.95 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.89 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.66 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  32.67 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>