More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0151 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.12 
 
 
672 aa  736    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.23 
 
 
794 aa  663    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.34 
 
 
704 aa  779    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.94 
 
 
684 aa  892    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  58.53 
 
 
697 aa  711    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  59.04 
 
 
682 aa  746    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  71.23 
 
 
696 aa  912    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.35 
 
 
743 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.35 
 
 
671 aa  723    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  56.56 
 
 
769 aa  695    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.21 
 
 
672 aa  816    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  71.65 
 
 
684 aa  930    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  68.36 
 
 
698 aa  870    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.18 
 
 
682 aa  891    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.88 
 
 
669 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.73 
 
 
685 aa  753    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.75 
 
 
801 aa  640    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  67.92 
 
 
753 aa  711    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.11 
 
 
602 aa  635    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  67.44 
 
 
784 aa  658    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.4 
 
 
615 aa  646    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.08 
 
 
793 aa  661    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.12 
 
 
662 aa  704    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  90.94 
 
 
687 aa  1222    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  67.23 
 
 
783 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  59.96 
 
 
627 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.43 
 
 
671 aa  728    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  61.61 
 
 
656 aa  765    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  57.95 
 
 
760 aa  657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.33 
 
 
753 aa  709    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.14 
 
 
659 aa  836    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  100 
 
 
689 aa  1392    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.81 
 
 
669 aa  903    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  60.95 
 
 
654 aa  747    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.54 
 
 
679 aa  750    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  62.38 
 
 
681 aa  766    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  67.23 
 
 
783 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.88 
 
 
781 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.86 
 
 
677 aa  839    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.52 
 
 
760 aa  688    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.44 
 
 
798 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.99 
 
 
653 aa  633  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.66 
 
 
657 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.51 
 
 
643 aa  629  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.61 
 
 
611 aa  623  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.88 
 
 
651 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.77 
 
 
635 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.5 
 
 
639 aa  613  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.49 
 
 
759 aa  611  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.34 
 
 
599 aa  609  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.53 
 
 
620 aa  611  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.55 
 
 
632 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.82 
 
 
630 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.19 
 
 
652 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  56.88 
 
 
693 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.57 
 
 
614 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.4 
 
 
608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.56 
 
 
639 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.66 
 
 
750 aa  599  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.09 
 
 
608 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.15 
 
 
612 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.78 
 
 
783 aa  600  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.07 
 
 
676 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  61.49 
 
 
633 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  61.7 
 
 
633 aa  593  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  61.49 
 
 
633 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  61.49 
 
 
633 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  61.49 
 
 
633 aa  592  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  61.49 
 
 
633 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  61.49 
 
 
633 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.57 
 
 
633 aa  592  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  61.49 
 
 
633 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 
612 aa  594  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  61.57 
 
 
633 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  57.2 
 
 
617 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  51.89 
 
 
613 aa  589  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.14 
 
 
635 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  58.75 
 
 
700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  56.43 
 
 
617 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.31 
 
 
607 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.73 
 
 
616 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.07 
 
 
640 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.15 
 
 
617 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.65 
 
 
640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.34 
 
 
648 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.1 
 
 
697 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.31 
 
 
638 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.1 
 
 
697 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.39 
 
 
640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.25 
 
 
643 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.9 
 
 
643 aa  578  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  56.43 
 
 
617 aa  582  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.43 
 
 
645 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.12 
 
 
616 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
621 aa  581  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.15 
 
 
671 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.55 
 
 
656 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.87 
 
 
608 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.85 
 
 
638 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.05 
 
 
638 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>