More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4384 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  100 
 
 		 400 aa  791    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  52.37 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  46.48 
 
 		 400 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  43.78 
 
 		 400 aa  282  9e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  46.29 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  42.78 
 
 		 408 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  39.18 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37.69 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  42.89 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  37.95 
 
 		 411 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  42.82 
 
 		 411 aa  255  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  36.92 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  42.61 
 
 		 423 aa  250  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  38.46 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  41.19 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  38.46 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  37.95 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  38.21 
 
 		 411 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  37.95 
 
 		 411 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.76 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  37.95 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  37.95 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  41.67 
 
 		 401 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  39.23 
 
 		 401 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.6 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  40.51 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  39.73 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  40.05 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.1 
 
 		 411 aa  239  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  39.9 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  40.46 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  38.95 
 
 		 399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  41.16 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  35.5 
 
 		 420 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  40.36 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  40.21 
 
 		 402 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  39.19 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  40.54 
 
 		 407 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  40.54 
 
 		 407 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  41.02 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  40.97 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  39.64 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  38.3 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  38.52 
 
 		 405 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.4 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  38.99 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  39.38 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  40.11 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  39.56 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  40.05 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  40.05 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  40.05 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  39.9 
 
 		 422 aa  226  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  39.14 
 
 		 408 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  39.58 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.68 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.86 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  40 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.42 
 
 		 395 aa  222  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.59 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  37.15 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  37.04 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  36.79 
 
 		 400 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.03 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  36.75 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  38.52 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  39.22 
 
 		 375 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.65 
 
 		 398 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37.06 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  38.3 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  39.13 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  35.75 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  44.81 
 
 		 443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  39.45 
 
 		 398 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  40.58 
 
 		 411 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  38.89 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  35.47 
 
 		 380 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  39.33 
 
 		 400 aa  212  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  37.34 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  42.15 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  39.41 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  40.17 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.55 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.25 
 
 		 402 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  37.95 
 
 		 424 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  42.86 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  42.86 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  39.02 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.86 
 
 		 392 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  40 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  42.86 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  38.79 
 
 		 421 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  38.69 
 
 		 367 aa  209  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  39.19 
 
 		 398 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  35.86 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  43.25 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  39.53 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  42.51 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  38.66 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  39.52 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>