250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1241 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 340 aa  674    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  79.53 
 
 		 341 aa  537  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  68.33 
 
 		 343 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  68.7 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  68.7 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  68.7 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  68.33 
 
 		 343 aa  454  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  66.86 
 
 		 343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.33 
 
 		 344 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  67.06 
 
 		 340 aa  435  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  65.57 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  64.97 
 
 		 339 aa  427  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.57 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  63.82 
 
 		 340 aa  418  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  65.38 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  65.38 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.37 
 
 		 337 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.91 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  63.77 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.02 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.6 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  60.48 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  60 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  60.78 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  59.1 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.52 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.73 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.03 
 
 		 351 aa  349  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  55.98 
 
 		 337 aa  348  5e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  55.13 
 
 		 337 aa  335  5.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.49 
 
 		 341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.41 
 
 		 340 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.81 
 
 		 346 aa  318  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.21 
 
 		 337 aa  302  6.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  48.26 
 
 		 350 aa  298  7e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  45.99 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  41.26 
 
 		 372 aa  255  9e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.09 
 
 		 345 aa  248  9e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  38.99 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  31.66 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.08 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.2 
 
 		 337 aa  190  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  31.36 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.29 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.27 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.38 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.55 
 
 		 344 aa  186  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.59 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.99 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.09 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  32.24 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.45 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  34.32 
 
 		 336 aa  180  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.09 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.44 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.29 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.7 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  28.19 
 
 		 344 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  34.27 
 
 		 352 aa  166  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.45 
 
 		 363 aa  165  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.27 
 
 		 348 aa  165  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  32.76 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.95 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.65 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 		 357 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  31.49 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.64 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  32.65 
 
 		 349 aa  162  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  34.19 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  32.65 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.82 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.46 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  29.5 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.91 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.86 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  31.35 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.98 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.95 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  32.49 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.42 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.85 
 
 		 355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.42 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  30.63 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  30.77 
 
 		 354 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.16 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.72 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.53 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.52 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  31.96 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  32.26 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  31.96 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>