More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1096 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  100 
 
 
525 aa  1036    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  46.77 
 
 
548 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  42.08 
 
 
548 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  42.65 
 
 
543 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  43.07 
 
 
541 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  40.56 
 
 
543 aa  299  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.83 
 
 
539 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.87 
 
 
538 aa  223  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.86 
 
 
545 aa  220  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.51 
 
 
543 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  32.35 
 
 
546 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  31.58 
 
 
543 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  34.13 
 
 
556 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  31.81 
 
 
549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.95 
 
 
564 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  32.07 
 
 
541 aa  209  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  33.21 
 
 
553 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.02 
 
 
584 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  34.21 
 
 
556 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  33.39 
 
 
537 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.84 
 
 
530 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.8 
 
 
575 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  33.08 
 
 
530 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.8 
 
 
575 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.04 
 
 
520 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.14 
 
 
557 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  32.97 
 
 
547 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  34.29 
 
 
540 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  32.17 
 
 
539 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  31.23 
 
 
532 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  28.97 
 
 
533 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  33.7 
 
 
545 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  30.78 
 
 
552 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  33.03 
 
 
547 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  31.95 
 
 
555 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  31.95 
 
 
555 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  29.8 
 
 
527 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.81 
 
 
583 aa  178  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  31.82 
 
 
554 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.25 
 
 
560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  31.59 
 
 
547 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  31.24 
 
 
542 aa  172  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  28.89 
 
 
527 aa  171  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.42 
 
 
535 aa  170  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.84 
 
 
546 aa  169  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.96 
 
 
564 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.57 
 
 
549 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.57 
 
 
583 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  29.94 
 
 
537 aa  166  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  26.51 
 
 
539 aa  166  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.04 
 
 
565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 
539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  31.91 
 
 
537 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  31.82 
 
 
544 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  25.84 
 
 
505 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.96 
 
 
543 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  30.26 
 
 
535 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.02 
 
 
537 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  28.31 
 
 
531 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.89 
 
 
520 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.9 
 
 
540 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  32.11 
 
 
544 aa  157  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.98 
 
 
522 aa  157  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.98 
 
 
522 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.56 
 
 
522 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  31.24 
 
 
554 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.25 
 
 
542 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  28.91 
 
 
536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  28.91 
 
 
536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  28.91 
 
 
536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.79 
 
 
522 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  30.68 
 
 
562 aa  153  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  29.3 
 
 
601 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.23 
 
 
522 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.61 
 
 
522 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.61 
 
 
522 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  36.48 
 
 
624 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.09 
 
 
574 aa  150  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25.38 
 
 
522 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.23 
 
 
569 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  30.8 
 
 
540 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  31.3 
 
 
537 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.31 
 
 
522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  29.59 
 
 
557 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.46 
 
 
522 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.97 
 
 
544 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.35 
 
 
579 aa  147  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  28.24 
 
 
533 aa  146  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.86 
 
 
556 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.33 
 
 
557 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  27.94 
 
 
522 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  27.2 
 
 
541 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 
549 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  24.58 
 
 
522 aa  145  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  24.16 
 
 
563 aa  144  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.51 
 
 
553 aa  143  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  27.34 
 
 
616 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  31.38 
 
 
545 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 
543 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  27.52 
 
 
601 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>