More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0091 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
219 aa  416  1e-115  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  61.35 
 
 
210 aa  234  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  61.06 
 
 
223 aa  197  8e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  53.36 
 
 
228 aa  195  4e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  59.62 
 
 
242 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  55.45 
 
 
226 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  58.14 
 
 
210 aa  163  2e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
254 aa  132  4e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
222 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  36.65 
 
 
240 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
268 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
248 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  37.8 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  37.29 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  35 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  34.66 
 
 
260 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
260 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  34.66 
 
 
260 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
268 aa  82.4  4e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
244 aa  82  7e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  33.52 
 
 
244 aa  80.1  2e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  36.77 
 
 
234 aa  79  5e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  33.5 
 
 
244 aa  75.9  4e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.84535e-07 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  38.42 
 
 
242 aa  75.9  5e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
278 aa  74.7  9e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
268 aa  74.3  1e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  41.88 
 
 
246 aa  71.6  8e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
268 aa  68.6  7e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
295 aa  67.4  2e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.75 
 
 
259 aa  66.2  4e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
267 aa  65.5  7e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  31.13 
 
 
249 aa  65.1  8e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.93 
 
 
256 aa  65.1  9e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
284 aa  64.7  1e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
284 aa  64.7  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
284 aa  64.7  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
284 aa  64.7  1e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
284 aa  64.7  1e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
284 aa  64.7  1e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
284 aa  64.7  1e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  35.71 
 
 
251 aa  63.5  2e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  34.76 
 
 
269 aa  63.5  2e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.94 
 
 
257 aa  63.9  2e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
254 aa  63.5  2e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
316 aa  62.8  3e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
316 aa  62.8  3e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
316 aa  62.8  3e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  33.75 
 
 
263 aa  63.2  3e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
316 aa  62.8  3e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
316 aa  62.8  4e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
316 aa  62.8  4e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.26 
 
 
254 aa  62.8  4e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
316 aa  62.8  4e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
284 aa  62.8  4e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.29 
 
 
261 aa  62.8  4e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  37.67 
 
 
253 aa  62.8  4e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
298 aa  62.8  4e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  36.18 
 
 
273 aa  62.4  5e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  31.29 
 
 
303 aa  62.4  5e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 
260 aa  62.4  5e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
298 aa  62  7e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
298 aa  62  7e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
316 aa  62  7e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.71 
 
 
265 aa  62  7e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
297 aa  62  7e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
286 aa  62  7e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 
251 aa  62  7e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
299 aa  61.6  8e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  35.97 
 
 
278 aa  61.6  8e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  33.11 
 
 
276 aa  61.6  9e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  37.61 
 
 
262 aa  61.6  9e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
283 aa  61.6  9e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
285 aa  61.6  9e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
314 aa  61.6  9e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  9.44679e-05 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
285 aa  61.2  1e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  36.43 
 
 
264 aa  61.2  1e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
314 aa  61.2  1e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
285 aa  61.2  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
285 aa  61.2  1e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
285 aa  60.8  2e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  33.93 
 
 
275 aa  60.5  2e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
285 aa  60.8  2e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.5 
 
 
252 aa  60.5  2e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
267 aa  60.5  2e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  2.86827e-13  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 
257 aa  60.5  2e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  38.36 
 
 
270 aa  60.5  2e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
285 aa  60.8  2e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.42 
 
 
253 aa  60.8  2e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
284 aa  60.1  2e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  33.93 
 
 
275 aa  60.5  2e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 
269 aa  60.5  2e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  32 
 
 
254 aa  60.1  3e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.40863e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
319 aa  59.7  3e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  32.92 
 
 
295 aa  59.7  3e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 
274 aa  60.1  3e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.05 
 
 
265 aa  60.1  3e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  34.06 
 
 
275 aa  59.7  4e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  27.85 
 
 
264 aa  59.3  4e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
310 aa  58.9  5e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0269788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>