More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0768 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  68.84 
 
 
518 aa  725    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  78.81 
 
 
512 aa  809    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
510 aa  1043    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  59.24 
 
 
540 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  58.84 
 
 
537 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  60 
 
 
529 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  60.04 
 
 
507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  58.02 
 
 
529 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  55.58 
 
 
505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  58.43 
 
 
527 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  56.4 
 
 
550 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  58 
 
 
550 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  56.46 
 
 
538 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  54.18 
 
 
503 aa  568  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  52.47 
 
 
526 aa  538  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  52.49 
 
 
512 aa  528  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  51.7 
 
 
507 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  52.8 
 
 
500 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  46.32 
 
 
503 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  43.45 
 
 
504 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  47.11 
 
 
503 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  37.8 
 
 
502 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 
570 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  37.35 
 
 
503 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.66 
 
 
473 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.66 
 
 
473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
468 aa  253  7e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
516 aa  248  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
471 aa  244  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  33.07 
 
 
467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
463 aa  230  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
412 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
568 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
500 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  32.71 
 
 
606 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
505 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  25.7 
 
 
486 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
487 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
395 aa  90.9  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
360 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 
387 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
412 aa  87.8  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08369  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14070)  34.81 
 
 
2822 aa  84.7  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  23.9 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
372 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  23.9 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  24.09 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.57 
 
 
373 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.89 
 
 
406 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  23.72 
 
 
350 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.31 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.16 
 
 
745 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02955  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07860)  30.94 
 
 
2880 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27.19 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
378 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  27.24 
 
 
383 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
374 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
384 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
382 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
1080 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  32.9 
 
 
822 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1197  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.788986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  26.95 
 
 
709 aa  70.5  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00194  hexosyltransferase  33.93 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  22.26 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>