More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2339 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2339  ABC metal ion transporter, periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 299 aa  594  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.591821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1530  periplasmic solute binding protein  93.98 
 
 		 299 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1625  periplasmic solute binding protein  94.31 
 
 		 299 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.624808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1535  periplasmic solute binding protein  75.27 
 
 		 299 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1548  periplasmic solute binding protein  37.33 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000077382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3917  periplasmic solute binding protein  40.94 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247464  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  39.15 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  39.15 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  39.15 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  39.15 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  38.43 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  40.98 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  40.84 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  40.84 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  40.08 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  40.46 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  37.72 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  35.05 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  39.54 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  37.73 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  37.65 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  36.11 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  39.68 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2538  zinc/manganese transport system substrate-binding protein  38.49 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0051  periplasmic solute binding protein  31.11 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.958228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0972  periplasmic solute binding protein  35.47 
 
 		 292 aa  158  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0180469  normal  0.0507696 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000605  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  32.86 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000153864  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06465  hypothetical protein  33.09 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0490  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2435  periplasmic solute binding protein  32.41 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0108745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3052  periplasmic solute binding protein  33.46 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  30.91 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  26.61 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  24.54 
 
 		 278 aa  85.9  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  26.06 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.57 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  26.8 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  23.91 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  31.15 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  26.04 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  29.25 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  28.09 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  28.89 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  29.11 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  27.55 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.12 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  25.72 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  34.81 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  24.24 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  25.77 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  28.46 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  26.17 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  24.89 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  26.69 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  23.97 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  30.35 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  26.16 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  23.76 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  25.51 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  24.91 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  26.46 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  24.54 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  26.63 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  25.97 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  26.67 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  25.69 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.67 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.02 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  24.81 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  24.63 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.67 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  27.73 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  24.1 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.67 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.67 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  28.62 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  25.62 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  26.67 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  23.81 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  27.01 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  26.28 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  26.61 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  26.94 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.93 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  25.51 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  23.47 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  21.91 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>