More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1548 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1548  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 294 aa  599  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000077382  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0051  periplasmic solute binding protein  49.45 
 
 		 292 aa  295  5e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.958228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  38.11 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  36.68 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  37.86 
 
 		 293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2538  zinc/manganese transport system substrate-binding protein  34.66 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  35.15 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  36.65 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  35.64 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  36.79 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  36.52 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  36.79 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  37.23 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  35.74 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  36.43 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  36.43 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  36.79 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  36.43 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1530  periplasmic solute binding protein  36.59 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  35.47 
 
 		 307 aa  208  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2339  ABC metal ion transporter, periplasmic solute binding protein  37.33 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.591821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1625  periplasmic solute binding protein  37.37 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.624808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  34.67 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3917  periplasmic solute binding protein  33.93 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247464  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0972  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0180469  normal  0.0507696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0490  periplasmic solute binding protein  31.73 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1535  periplasmic solute binding protein  38.19 
 
 		 299 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000605  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  31.4 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000153864  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06465  hypothetical protein  31.02 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  28.83 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2435  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0108745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3052  periplasmic solute binding protein  30.52 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  31.82 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  32.18 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  27 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 365 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25.94 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  25.81 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  25.74 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0123  periplasmic solute binding protein  24.09 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  25.93 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  28.94 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  26.77 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  25.29 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  25.16 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  26.47 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  25.19 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  24.84 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  24.84 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  24.46 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.84 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  23.05 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  22.94 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  23.74 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  31.97 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  27.07 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  24.53 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  23.21 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  24.52 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  25.69 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.52 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  23.19 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  24.52 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  27.41 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  23.76 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  25.98 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  24.25 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  22.8 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1968  periplasmic solute binding protein  22.8 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  24.72 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  26.05 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  25.63 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  25.29 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  23.99 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  24.9 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  26.79 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  23.08 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  24.14 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2115  periplasmic solute binding protein  22.83 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181464  normal  0.0892527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  23.63 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  24.91 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  24.6 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  25.1 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  26.46 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  22.8 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  23.94 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  23.51 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  22.22 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  25.31 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  22.51 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  25.37 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  25.38 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>