More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0328 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  100 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  99.66 
 
 		 312 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  99.66 
 
 		 320 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  99.66 
 
 		 320 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  99.31 
 
 		 393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  99.31 
 
 		 320 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  98.63 
 
 		 320 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  93.47 
 
 		 333 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  78.67 
 
 		 313 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  78.7 
 
 		 304 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  81.95 
 
 		 303 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  81.58 
 
 		 303 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  81.58 
 
 		 303 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  72.13 
 
 		 330 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  72.13 
 
 		 322 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  82.28 
 
 		 304 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  73.14 
 
 		 309 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  80.08 
 
 		 304 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  47.14 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  47.14 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  43.46 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  39.93 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  42.51 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  40.82 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  41.49 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  38.72 
 
 		 324 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  37.59 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  43.75 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  35.38 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  36.07 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.57 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  36.67 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  38.35 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  37.63 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  35.79 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  36.15 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  33.08 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.96 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  32.3 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  37.5 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  32.76 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  35.19 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  37.13 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  37.13 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  34.72 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  34.8 
 
 		 511 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.86 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  34.72 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  28.97 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.18 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  27.17 
 
 		 350 aa  106  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.68 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  29.12 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  31.39 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  27.73 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.73 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  29.74 
 
 		 315 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  27.81 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 309 aa  92  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.46 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.84 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  28.28 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  28.09 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 		 299 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  25.64 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  28.99 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  35.51 
 
 		 319 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  28.8 
 
 		 277 aa  85.9  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  27.13 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 318 aa  85.5  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  26 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  28.94 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  30.24 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  27.87 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  25.36 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  27.16 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.6 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  26.82 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  29.27 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  26.16 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  31.18 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  29.38 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  32.87 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>