More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0490 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0490  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0972  periplasmic solute binding protein  58.5 
 
 		 292 aa  322  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0180469  normal  0.0507696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2435  periplasmic solute binding protein  45.99 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0108745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3052  periplasmic solute binding protein  45.96 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1548  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000077382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2538  zinc/manganese transport system substrate-binding protein  37 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  34.12 
 
 		 298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3917  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247464  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  32 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0051  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.958228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  31.74 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  32.09 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1530  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  30.79 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  32.92 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  32.92 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  32.08 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  31.43 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  31.43 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  31.39 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1625  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.624808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2339  ABC metal ion transporter, periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.591821  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06465  hypothetical protein  32.11 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000605  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  30.77 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000153864  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  29.2 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1535  periplasmic solute binding protein  34.17 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  23.57 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  29.47 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  30.52 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  25.72 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.62 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  25.99 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  27.6 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  25.16 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  27.89 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  30.7 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  26.12 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  23.92 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  25.27 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  24.28 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  25.74 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  23.96 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  27.32 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  33.2 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  25.3 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  27.59 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  25.3 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  23.47 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  23.59 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  22.22 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  23.59 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  23.59 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  23.59 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.25 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  25.86 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  23.24 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  26.49 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1968  periplasmic solute binding protein  26.49 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  25.47 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  24.41 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  22.17 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  26.36 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  23.44 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  22.5 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  24.33 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  22.87 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  28.41 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  27.13 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.74 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  31.16 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  20.88 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  29.89 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2115  periplasmic solute binding protein  25.75 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181464  normal  0.0892527 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.41 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  20.88 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  25 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  25.45 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  23.91 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  21.22 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.64 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  22.95 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  21.92 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  30.65 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  22.67 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  27.85 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  21.2 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  30.63 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  23.67 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>