292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0199 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
298 aa  604  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2538  zinc/manganese transport system substrate-binding protein  60.85 
 
 
297 aa  371  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41437  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  48.94 
 
 
293 aa  297  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  47.87 
 
 
302 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  47.52 
 
 
302 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  47.52 
 
 
302 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  47.52 
 
 
302 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  47.4 
 
 
302 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  47.16 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  47.16 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  47.16 
 
 
302 aa  285  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  47.48 
 
 
303 aa  285  9e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  48.41 
 
 
302 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  46.04 
 
 
303 aa  281  9e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  46.43 
 
 
307 aa  277  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  45.04 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  43.2 
 
 
304 aa  272  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  43.62 
 
 
315 aa  269  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000605  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  40.64 
 
 
308 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000153864  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06465  hypothetical protein  39.86 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1548  periplasmic solute binding protein  35.15 
 
 
294 aa  219  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000077382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3917  periplasmic solute binding protein  41.57 
 
 
309 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247464  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0972  periplasmic solute binding protein  38.14 
 
 
292 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0180469  normal  0.0507696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1530  periplasmic solute binding protein  35.74 
 
 
299 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0051  periplasmic solute binding protein  31.97 
 
 
292 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.958228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1625  periplasmic solute binding protein  34.93 
 
 
299 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.624808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2339  ABC metal ion transporter, periplasmic solute binding protein  35.05 
 
 
299 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.591821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1535  periplasmic solute binding protein  38.61 
 
 
299 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0490  periplasmic solute binding protein  34.43 
 
 
300 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2435  periplasmic solute binding protein  34.12 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0108745  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3052  periplasmic solute binding protein  37.39 
 
 
301 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  26.88 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  23.59 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25.27 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  24.48 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  24.37 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  28.96 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  22.88 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  22.34 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  28.42 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  25.2 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  28.42 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  22.84 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  26.35 
 
 
345 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  28.08 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  27.78 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  30.29 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  26.58 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  28.45 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  26.51 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  21.33 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  22.65 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  21.55 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  30.57 
 
 
393 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  30.57 
 
 
291 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.57 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.57 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.57 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.57 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  26.19 
 
 
316 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.05 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  22.65 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  26.94 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  21.9 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  26.87 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  23.75 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  27.98 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  25.54 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  21.9 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  27.98 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  27.98 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  21.57 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  28.35 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  21.57 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  24.89 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  25.58 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  20.85 
 
 
292 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  21.57 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  21.57 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  26.27 
 
 
353 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  27.75 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 
304 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  24.09 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  29.35 
 
 
333 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  24.26 
 
 
326 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  32.29 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  21.55 
 
 
313 aa  58.9  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  24.66 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  25.87 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  20.47 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  23.37 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  34.04 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  25.87 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  21.55 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>