More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1625 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1625  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 299 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.624808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1530  periplasmic solute binding protein  97.32 
 
 		 299 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2339  ABC metal ion transporter, periplasmic solute binding protein  94.31 
 
 		 299 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.591821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1535  periplasmic solute binding protein  75.27 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1548  periplasmic solute binding protein  37.37 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000077382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3917  periplasmic solute binding protein  40.94 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247464  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  40.84 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  40.84 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  42.11 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  40.84 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  40.84 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  42.11 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  41 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  40.08 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  41.7 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  42.11 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  39.1 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  34.93 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  39.16 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  37.36 
 
 		 307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  37.55 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  38.75 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2538  zinc/manganese transport system substrate-binding protein  36.8 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  40.08 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0051  periplasmic solute binding protein  33.06 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.958228  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000605  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  33.69 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000153864  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06465  hypothetical protein  33.69 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0972  periplasmic solute binding protein  39.32 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0180469  normal  0.0507696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0490  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2435  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0108745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3052  periplasmic solute binding protein  33.82 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  30.88 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  26.33 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  24.05 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  27.11 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  26.57 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  26.98 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  26.07 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  27.68 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  23.91 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  28.36 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  28.46 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  24.82 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  25.77 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  34.81 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  28.96 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  24.72 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  28.23 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  24.53 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  27.59 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  26.64 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  29.07 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  25.23 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  25.4 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  27.43 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  25.53 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  24.25 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  24.5 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.21 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  25.81 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  32.41 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.87 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  25.97 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  26.34 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  28.1 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  26.38 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  25.6 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  28.22 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  28.03 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  28.17 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  26.47 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  25.7 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  24.37 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25.36 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  24.48 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  25.85 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  26.32 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  25.38 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.67 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.32 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  26.28 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  23.08 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  27.03 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  26.91 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  25.26 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  28.8 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.32 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>