233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3715 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  77.05 
 
 		 303 aa  487  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  74.27 
 
 		 304 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  74.59 
 
 		 302 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  74.92 
 
 		 302 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  74.59 
 
 		 302 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  72.94 
 
 		 302 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  72.94 
 
 		 302 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  72.61 
 
 		 302 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  75.44 
 
 		 293 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  72.61 
 
 		 302 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  71.8 
 
 		 303 aa  461  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  73.27 
 
 		 302 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  74.73 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  71.48 
 
 		 288 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  65.68 
 
 		 315 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2538  zinc/manganese transport system substrate-binding protein  52.88 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000605  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  49.84 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000153864  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06465  hypothetical protein  47.68 
 
 		 308 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  46.43 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1548  periplasmic solute binding protein  35.47 
 
 		 294 aa  208  7e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000077382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1530  periplasmic solute binding protein  36.98 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0051  periplasmic solute binding protein  34.19 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.958228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1625  periplasmic solute binding protein  37.36 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.624808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2339  ABC metal ion transporter, periplasmic solute binding protein  37.73 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.591821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3917  periplasmic solute binding protein  36.75 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247464  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0972  periplasmic solute binding protein  34.53 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0180469  normal  0.0507696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1535  periplasmic solute binding protein  40.23 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0490  periplasmic solute binding protein  30.8 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2435  periplasmic solute binding protein  34.62 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0108745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3052  periplasmic solute binding protein  34.94 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  24.39 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  25.75 
 
 		 368 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  26.94 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  22.08 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  23.7 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  24.4 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  24.15 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  25.24 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  24.58 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  20.95 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  20.95 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  20.95 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  22.99 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  27.91 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  21.79 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  21.54 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  25.49 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  20.55 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  20.16 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  20.16 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  23.44 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  20.55 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  24.59 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  21.4 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  29.38 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  23.16 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  23.16 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  21.16 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  31.31 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  26.84 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  21.53 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.31 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.31 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.31 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.31 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  23.35 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  23.61 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  30.15 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  19.48 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  25.42 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  24.35 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  22.41 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.81 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  22.7 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  23.94 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  21.76 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  23.25 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  21.95 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  23.33 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  25.11 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  24.35 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  22.69 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  20.53 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  25.42 
 
 		 346 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  26.07 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  28.21 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  25.91 
 
 		 335 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  26.06 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  22.31 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  22.73 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0998  periplasmic solute binding protein  25.42 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0851489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>