24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0998 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0998  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 331 aa  674    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0851489 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0128  periplasmic solute binding protein  62.26 
 
 		 328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.1714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1888  periplasmic solute binding protein  62.16 
 
 		 326 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.447196 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1367  periplasmic solute binding protein  51.2 
 
 		 378 aa  323  3e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.508502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0121  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0314427  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  25.86 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  25.42 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  26.72 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  25.59 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  26.72 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  26.72 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  26.5 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  25.32 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  26.29 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  26.29 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  26.29 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  26.29 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  23.81 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  31.05 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  25.86 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.83 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  32.42 
 
 		 311 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  25.32 
 
 		 288 aa  42.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  23.38 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>